255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7012 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 321 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  38.89 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  36.08 
 
 		 270 aa  103  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  35.29 
 
 		 272 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  37.97 
 
 		 267 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  31.35 
 
 		 376 aa  98.6  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  33.7 
 
 		 281 aa  97.4  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  35.62 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  31.18 
 
 		 259 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  29.49 
 
 		 256 aa  94  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  28.68 
 
 		 374 aa  94  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  29.93 
 
 		 293 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4807  fatty acid hydroxylase  36 
 
 		 249 aa  93.2  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  32.86 
 
 		 265 aa  93.2  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  35.37 
 
 		 330 aa  92.4  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  35.37 
 
 		 330 aa  92.4  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  31.37 
 
 		 256 aa  92.8  8e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  33.33 
 
 		 283 aa  92.4  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  31.73 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  33.1 
 
 		 273 aa  92  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 		 256 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  30 
 
 		 374 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  28.68 
 
 		 374 aa  92  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  33.76 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  32.42 
 
 		 304 aa  90.9  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  31.22 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  30.73 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5286  hypothetical protein  29.01 
 
 		 323 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.789525  normal  0.137555 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  34.04 
 
 		 431 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5722  hypothetical protein  29.01 
 
 		 323 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  27.56 
 
 		 275 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  28.89 
 
 		 274 aa  89.7  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  31.16 
 
 		 267 aa  89.7  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  27.94 
 
 		 274 aa  89.7  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  32.28 
 
 		 272 aa  89  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  31.14 
 
 		 278 aa  89  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  33.86 
 
 		 431 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  33.55 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  34.44 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  28.21 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  31.37 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  32.64 
 
 		 324 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  30.29 
 
 		 273 aa  86.7  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  33.84 
 
 		 297 aa  86.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5741  hypothetical protein  33.33 
 
 		 320 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  34.87 
 
 		 328 aa  86.7  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  33.33 
 
 		 431 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  33.77 
 
 		 320 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  31.75 
 
 		 386 aa  85.9  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  31.15 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  31.38 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  29.41 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  31.94 
 
 		 324 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  34.72 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  32.06 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  32.41 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  30.27 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  28.63 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  30.1 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  30.1 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  29.61 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  30.1 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  30.49 
 
 		 597 aa  83.6  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  32.32 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  29.9 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  29.06 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  30.35 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  31.72 
 
 		 402 aa  82.8  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  30.66 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  31.75 
 
 		 431 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  30.1 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  28.04 
 
 		 426 aa  82.4  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  35.29 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  32.26 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  29.73 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  32.85 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  29.88 
 
 		 597 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  32.69 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  30.81 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  30.05 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5320  hypothetical protein  31.05 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.573782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  28.43 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  31.65 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  35.71 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1074  fatty acid hydroxylase  34.59 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5691  hypothetical protein  31.05 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.460531 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  26.6 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  32.69 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5467  hypothetical protein  31.41 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189673  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  32.89 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  31.88 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  29.88 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  33.33 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  32.82 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  33.11 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3683  hypothetical protein  30.59 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  32.16 
 
 		 626 aa  80.1  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  28.06 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  29.19 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>