258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0389 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  100 
 
 		 279 aa  573  1.0000000000000001e-163  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  52.87 
 
 		 272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  50.37 
 
 		 272 aa  279  4e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  50.21 
 
 		 270 aa  264  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  47.53 
 
 		 267 aa  249  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  47.71 
 
 		 281 aa  241  7.999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  44.19 
 
 		 273 aa  239  5e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  44.32 
 
 		 265 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  45.49 
 
 		 283 aa  235  7e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  42.16 
 
 		 292 aa  235  7e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  46.67 
 
 		 259 aa  232  6e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  48.29 
 
 		 273 aa  229  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  46.9 
 
 		 295 aa  229  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  45.63 
 
 		 270 aa  227  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  44.31 
 
 		 304 aa  224  9e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  44.06 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  44.06 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  42.11 
 
 		 278 aa  216  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  43.7 
 
 		 272 aa  217  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  41.43 
 
 		 287 aa  209  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  42.21 
 
 		 256 aa  210  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  41.98 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  41.41 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  46.7 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  43.85 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  42.24 
 
 		 282 aa  199  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  38.85 
 
 		 268 aa  178  8e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  31.46 
 
 		 284 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  39.9 
 
 		 283 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  36.74 
 
 		 274 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  34.07 
 
 		 274 aa  142  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  34.81 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  38.79 
 
 		 289 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  30.77 
 
 		 278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  32.43 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  35.07 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  36.02 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  28.84 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  34.16 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  38.89 
 
 		 321 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  32.72 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  31.28 
 
 		 276 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  32.05 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  32.67 
 
 		 376 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  34.01 
 
 		 374 aa  92.4  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  30.92 
 
 		 380 aa  92  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  30.86 
 
 		 336 aa  88.6  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4808  hypothetical protein  31.58 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0507867  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4845  fatty acid hydroxylase  27.94 
 
 		 323 aa  87  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  28.38 
 
 		 314 aa  86.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  32.19 
 
 		 275 aa  85.9  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  29.11 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55230  hypothetical protein  30.54 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.226286  hitchhiker  0.000000221588 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  29.11 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  31.64 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  32.88 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  35.47 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  30.19 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  35.47 
 
 		 304 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  34.31 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  34.31 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  34.31 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  34.31 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  29.59 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  30.39 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  36.62 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  31.52 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  30.56 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  33.1 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  29.78 
 
 		 402 aa  79.3  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  31.85 
 
 		 400 aa  79.3  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  24.45 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  32.97 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  28.45 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  31.87 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  31.32 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  30.84 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  26.34 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  29.31 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  27.07 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  26.67 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  30 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  29.24 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  29.85 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  30.53 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  27.69 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  33.72 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  28.02 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  29.7 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0321  fatty acid hydroxylase  29.81 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4648  sterol desaturase-like protein  32.3 
 
 		 356 aa  75.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  30.34 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  32.37 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  29.21 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3695  fatty acid hydroxylase  27.51 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00011612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  29.21 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5310  fatty acid hydroxylase  30.48 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000145361  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  33.72 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  33.72 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  26.17 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>