241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03450 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  548  1e-155  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  38.32 
 
 		 278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  35.71 
 
 		 284 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  35.77 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  35.41 
 
 		 278 aa  143  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  34.07 
 
 		 279 aa  142  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  32.41 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  37.44 
 
 		 272 aa  137  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  32.78 
 
 		 264 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  34.13 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  36.51 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  36.51 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  34.12 
 
 		 283 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  32.37 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  28.79 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  36.04 
 
 		 270 aa  126  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  33.64 
 
 		 273 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  31.82 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  36.52 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  32.49 
 
 		 281 aa  122  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  34.04 
 
 		 287 aa  122  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  37.04 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  34.85 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  31.98 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  32.67 
 
 		 273 aa  119  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  32.03 
 
 		 272 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  35.71 
 
 		 283 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  33.01 
 
 		 282 aa  115  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  38.12 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  29.76 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  38.12 
 
 		 256 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  28.79 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  28.16 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  30.91 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  29.17 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  30.08 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  32.23 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  33.78 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  30.77 
 
 		 259 aa  96.7  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 		 289 aa  96.3  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  31.79 
 
 		 289 aa  92  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  30.87 
 
 		 385 aa  90.9  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  30.9 
 
 		 401 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  30.9 
 
 		 401 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  27.94 
 
 		 321 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  27.46 
 
 		 336 aa  89.7  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  30.87 
 
 		 376 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  29.6 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  32.87 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  31.48 
 
 		 376 aa  82.4  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  34.07 
 
 		 402 aa  82.4  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  34.97 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  26.39 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  28.57 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  28.57 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  35.14 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  28.57 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  28.44 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  27.8 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  29.93 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  29.63 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  25.84 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  28.16 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3695  fatty acid hydroxylase  32.03 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00011612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  30 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  30.65 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  26.74 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1074  fatty acid hydroxylase  30.29 
 
 		 399 aa  72.8  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  26.6 
 
 		 413 aa  72.8  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  31.35 
 
 		 400 aa  72.4  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  32.69 
 
 		 319 aa  72  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  30 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  25.84 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  30 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  30 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  30 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  30 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  30 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  30.49 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  36 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  29.51 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  32.3 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  32.7 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  31.25 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  30.34 
 
 		 431 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  29.27 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  29.27 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2332  hypothetical protein  27.27 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  25.25 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  27.13 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  29.27 
 
 		 332 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  29.17 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  24.34 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  24.87 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  24.89 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  29.61 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  30.82 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  32.24 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  29.38 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  29.38 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>