255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0972 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  100 
 
 
272 aa  549  1e-155  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  91.18 
 
 
272 aa  505  9.999999999999999e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  59.39 
 
 
270 aa  306  3e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  50.37 
 
 
279 aa  289  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  48.68 
 
 
265 aa  266  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  47.19 
 
 
330 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  47.19 
 
 
330 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  45.93 
 
 
283 aa  237  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  45.22 
 
 
278 aa  237  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  45.21 
 
 
267 aa  231  9e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  43.94 
 
 
270 aa  229  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  44.71 
 
 
272 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  43.02 
 
 
273 aa  223  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  41.9 
 
 
295 aa  217  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  43.41 
 
 
281 aa  215  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  42.75 
 
 
268 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  44.15 
 
 
264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  42.97 
 
 
304 aa  212  4.9999999999999996e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  42.58 
 
 
267 aa  212  5.999999999999999e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  43.77 
 
 
270 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  40.68 
 
 
256 aa  206  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  39.54 
 
 
256 aa  206  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  38.6 
 
 
292 aa  202  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  42.75 
 
 
287 aa  201  8e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  47.35 
 
 
259 aa  193  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  43.53 
 
 
282 aa  194  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  43.75 
 
 
273 aa  190  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  32.03 
 
 
289 aa  136  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  33.86 
 
 
274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  33.59 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  37.04 
 
 
274 aa  132  9e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  30.17 
 
 
284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  37.5 
 
 
264 aa  126  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  29.02 
 
 
276 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  34.69 
 
 
283 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  34.21 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  29.57 
 
 
288 aa  119  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  34 
 
 
291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  35.33 
 
 
257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  34.62 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  30.27 
 
 
278 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  37.82 
 
 
376 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  40.29 
 
 
374 aa  99.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  38.19 
 
 
337 aa  96.7  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  33.33 
 
 
385 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  35.33 
 
 
401 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  35.33 
 
 
401 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  33.33 
 
 
282 aa  92.4  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  33.1 
 
 
321 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  33.12 
 
 
373 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  33.12 
 
 
301 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  33.12 
 
 
373 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  33.12 
 
 
374 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  30.15 
 
 
275 aa  86.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  31.22 
 
 
413 aa  85.5  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  37.06 
 
 
386 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  32.95 
 
 
374 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  32.21 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  26.98 
 
 
431 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  30.51 
 
 
380 aa  82.4  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  30.11 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  24.77 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  28.48 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  27.72 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  32.56 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  20.51 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  26.62 
 
 
431 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  29 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4808  hypothetical protein  30.73 
 
 
305 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0507867  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  29.46 
 
 
295 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  26.26 
 
 
431 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  25.82 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  28.44 
 
 
430 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  32.73 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  27.75 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  33.54 
 
 
400 aa  76.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2751  hypothetical protein  30.57 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5467  hypothetical protein  32.78 
 
 
411 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189673  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  35.42 
 
 
377 aa  75.9  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  28.99 
 
 
407 aa  75.5  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  26.26 
 
 
431 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55230  hypothetical protein  29.26 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.226286  hitchhiker  0.000000221588 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4807  fatty acid hydroxylase  34.34 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  30.77 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  30.77 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  30.77 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  31.98 
 
 
407 aa  73.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  30.77 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  30.77 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  30.26 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2374  fatty acid hydroxylase  28.34 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00297557  normal  0.604187 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  30.77 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2304  fatty acid hydroxylase  28.76 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3388  hypothetical protein  33.74 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0628245  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39990  hypothetical protein  33.74 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  30 
 
 
402 aa  72.4  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  29.17 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  28.66 
 
 
324 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  30.07 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  28.66 
 
 
324 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>