243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1362 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
257 aa  517  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  64.31 
 
 
258 aa  333  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  62.06 
 
 
264 aa  324  8.000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  60.47 
 
 
264 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  33.98 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1077  hypothetical protein  33.2 
 
 
220 aa  136  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  37.5 
 
 
256 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  33.07 
 
 
284 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  32.37 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  29.84 
 
 
281 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  39.66 
 
 
274 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  32.43 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  30.77 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  41.55 
 
 
270 aa  128  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  38.12 
 
 
273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  38.76 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  36.06 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  36.2 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  32.95 
 
 
267 aa  125  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  37.78 
 
 
272 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  33.48 
 
 
273 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  35.12 
 
 
292 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  31.54 
 
 
264 aa  122  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  34.91 
 
 
289 aa  122  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  31.66 
 
 
330 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  31.66 
 
 
330 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  34.62 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  35.53 
 
 
289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  31.98 
 
 
274 aa  120  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  29.92 
 
 
304 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  36.76 
 
 
259 aa  118  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  35.36 
 
 
278 aa  116  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  38.89 
 
 
337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  36.11 
 
 
268 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  32.26 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  30.86 
 
 
270 aa  113  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  30.62 
 
 
278 aa  112  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  34.43 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  33.15 
 
 
287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  31.31 
 
 
288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  30.8 
 
 
291 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  34.25 
 
 
270 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  33.51 
 
 
328 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  29.17 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  29.51 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  30.63 
 
 
385 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  28.87 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  30.63 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  30.63 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  37.8 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  34.03 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  29.71 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  31.94 
 
 
325 aa  79  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  30.06 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  30.06 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  28.23 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  25.66 
 
 
285 aa  77  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  30.86 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  32 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  32 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  32 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  31.93 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  26.44 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  27.72 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  27.48 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39990  hypothetical protein  32.7 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  31.64 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  26.84 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6122  fatty acid hydroxylase  31.53 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  26.42 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  27.66 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  27.62 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  27.32 
 
 
314 aa  72  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  28 
 
 
312 aa  72  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3388  hypothetical protein  32.08 
 
 
255 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0628245  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  27.62 
 
 
291 aa  72  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  36.81 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0689  sterol desaturase-like protein  30.29 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  28.81 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  29.52 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  28.64 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3695  fatty acid hydroxylase  25.44 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00011612  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  29.52 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  32.9 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  29.93 
 
 
407 aa  69.3  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  25.58 
 
 
413 aa  68.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  26.13 
 
 
315 aa  68.9  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4648  sterol desaturase-like protein  28.65 
 
 
356 aa  68.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3860  hypothetical protein  28.09 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1221  fatty acid hydroxylase  27.68 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.387146  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  27.1 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  27.33 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5310  fatty acid hydroxylase  27.46 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000145361  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  28.23 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  25.13 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  30.52 
 
 
626 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2751  hypothetical protein  31.85 
 
 
240 aa  67  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  30.25 
 
 
303 aa  67  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  25.63 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  26.5 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>