35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1077 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1077  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  448  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  36.4 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  33.2 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  34.84 
 
 		 264 aa  135  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  35.15 
 
 		 258 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  32.74 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  26.92 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  34.21 
 
 		 287 aa  54.7  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  28.36 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  28.57 
 
 		 304 aa  52.8  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  30.51 
 
 		 256 aa  52.4  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  25.86 
 
 		 282 aa  52  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  34.94 
 
 		 270 aa  51.6  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  32.71 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  35.53 
 
 		 256 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  37.31 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  25 
 
 		 292 aa  48.9  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  24.04 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  32.88 
 
 		 337 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  27.63 
 
 		 267 aa  46.2  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  30.26 
 
 		 270 aa  46.2  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  26.61 
 
 		 274 aa  45.8  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  30.26 
 
 		 283 aa  45.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  30.61 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  35.82 
 
 		 330 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  28.92 
 
 		 274 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  35.82 
 
 		 330 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  29.31 
 
 		 264 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  26.37 
 
 		 270 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  26.58 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  28.92 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  27.37 
 
 		 283 aa  42.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  23.6 
 
 		 289 aa  42.4  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  24.83 
 
 		 289 aa  42.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  29.36 
 
 		 259 aa  42.4  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>