245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1116 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 258 aa  522  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  64.31 
 
 		 257 aa  353  2e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  66.14 
 
 		 264 aa  340  1e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  65.06 
 
 		 264 aa  338  4e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  38.71 
 
 		 274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  33.47 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1077  hypothetical protein  35.15 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  37.86 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  35.09 
 
 		 283 aa  142  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  34.3 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  32.39 
 
 		 267 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  37.98 
 
 		 256 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  33.74 
 
 		 270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  30.91 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  32.9 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  37.13 
 
 		 278 aa  132  7.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  35.14 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  35.33 
 
 		 283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  33.64 
 
 		 304 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  34.16 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  38.2 
 
 		 289 aa  126  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  35.23 
 
 		 273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  30.89 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  40.14 
 
 		 337 aa  125  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  32.07 
 
 		 289 aa  125  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  42.57 
 
 		 270 aa  125  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  35.68 
 
 		 272 aa  125  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  34.85 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  31.4 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  33.2 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  32.29 
 
 		 282 aa  121  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  33.33 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  34.08 
 
 		 330 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  34.08 
 
 		 330 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  31.47 
 
 		 267 aa  119  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  32.44 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  31.22 
 
 		 270 aa  115  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  31.94 
 
 		 288 aa  115  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  32.23 
 
 		 274 aa  115  8.999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  34.62 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  31.65 
 
 		 291 aa  105  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  28.79 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  30.51 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  28.5 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  32.97 
 
 		 376 aa  85.9  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  30.11 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  35.06 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  30.59 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  36.03 
 
 		 281 aa  82  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  32.31 
 
 		 325 aa  82  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  31.25 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  28.57 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  36.55 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  36.55 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  36.55 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  36.55 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  30.48 
 
 		 336 aa  78.6  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  29.24 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  30 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  30 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  27.62 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39990  hypothetical protein  28.8 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  34.67 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  29.14 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  33.09 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  34.27 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3695  fatty acid hydroxylase  28.33 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00011612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  31.51 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3388  hypothetical protein  28.8 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0628245  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  28.12 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  33.56 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  25.81 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  27.75 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  35.1 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  27.53 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  27.92 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  27 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2751  hypothetical protein  30.92 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  28.4 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  26.11 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  27.03 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  26.39 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  30.3 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  27.12 
 
 		 426 aa  72  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2332  hypothetical protein  26.94 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  28.45 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  30.05 
 
 		 597 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  32.48 
 
 		 626 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  30.05 
 
 		 597 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  28.93 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  31.13 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3780  fatty acid hydroxylase  31.05 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  30.46 
 
 		 431 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  26.5 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  25.89 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  30.46 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  26.4 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  25.89 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  29.8 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  24.08 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>