250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1443 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 264 aa  522  1e-147  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  87.83 
 
 		 264 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  62.06 
 
 		 257 aa  324  9e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  66.67 
 
 		 258 aa  321  6e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  33.06 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1077  hypothetical protein  36.4 
 
 		 220 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  38.55 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  39.79 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  35.07 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  32.37 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  29.85 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  39.08 
 
 		 278 aa  125  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  38.62 
 
 		 270 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  37.93 
 
 		 256 aa  125  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  30.62 
 
 		 267 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  35.6 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  35.29 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  36.02 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  37.65 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  30.97 
 
 		 273 aa  122  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  38.18 
 
 		 292 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  37.36 
 
 		 256 aa  122  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  39.63 
 
 		 282 aa  122  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  37.71 
 
 		 283 aa  122  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  43.48 
 
 		 337 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  32.13 
 
 		 304 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  37.87 
 
 		 272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  40.11 
 
 		 289 aa  118  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  40 
 
 		 289 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  33.8 
 
 		 270 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  36.7 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  39.08 
 
 		 272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  35.8 
 
 		 330 aa  115  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  35.8 
 
 		 330 aa  115  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  36.75 
 
 		 287 aa  115  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  36.72 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  35.23 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  30.28 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  36.65 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  32.87 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  34.87 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  31.82 
 
 		 291 aa  102  9e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  33.72 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  38.97 
 
 		 281 aa  85.9  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  29.95 
 
 		 276 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  29.2 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  32.72 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  29.44 
 
 		 401 aa  82  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  29.44 
 
 		 401 aa  82  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  30.29 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39990  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  29.88 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  33.85 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3388  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0628245  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  33.85 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  33.85 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  26.04 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  35.71 
 
 		 380 aa  79  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  33.85 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  32.91 
 
 		 374 aa  79  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  30.85 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  36.11 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  35.42 
 
 		 431 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  31.93 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  28.72 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  30.81 
 
 		 374 aa  75.9  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  30.22 
 
 		 325 aa  75.5  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  35.21 
 
 		 431 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2751  hypothetical protein  36.15 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  30.72 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  35.21 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  27.72 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  26.11 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  34.97 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  28.92 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  27.69 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  29.5 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3695  fatty acid hydroxylase  25 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00011612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  34.48 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  30.72 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  24.81 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  28.78 
 
 		 400 aa  72.4  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  34.57 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  29.41 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  30.07 
 
 		 321 aa  72  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11844  membrane-bound C-5 sterol desaturase erg3 (sterol-c5-desaturase)  30.11 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  28.72 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  35.29 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1221  hypothetical protein  26.45 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31242  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  32.24 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3780  fatty acid hydroxylase  32.5 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  32.24 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  28.81 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0689  sterol desaturase-like protein  29.59 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  31.85 
 
 		 407 aa  69.3  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  31.82 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0951  hypothetical protein  31.79 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46520  hypothetical protein  32.93 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374857  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  28.57 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  32.24 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>