234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4620 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 288 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  33.7 
 
 		 281 aa  99  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  33.52 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  31.22 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  31.43 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  30.29 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  27.66 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  29.05 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  30.29 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  30.11 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  27.89 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  34.09 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  31.25 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  31.25 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  31.25 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  30.6 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  29.61 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  31.25 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  30.86 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  28.85 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1629  fatty acid hydroxylase  28.03 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0812703  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  29.82 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  31.77 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  31.48 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  30.77 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  31.21 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0689  sterol desaturase-like protein  28.31 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  32.72 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  29.84 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  28.4 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  32.4 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  30.17 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  28.03 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  29.48 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11844  membrane-bound C-5 sterol desaturase erg3 (sterol-c5-desaturase)  28.99 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2079  hypothetical protein  32.61 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.768511  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  27.88 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  28.85 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  29.28 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  27.95 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  27.14 
 
 		 626 aa  70.1  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  31.16 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  28.46 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  26.46 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  28.72 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  29.36 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  29.36 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  29.36 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  29.36 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  29.36 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  29.36 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  34.62 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  31.02 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  28.9 
 
 		 327 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  28.4 
 
 		 332 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  31.25 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3418  sterol desaturase-related protein  31.16 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0225552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2864  sterol desaturase-related protein  31.16 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  26.28 
 
 		 597 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2908  sterol desaturase-related protein  31.16 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  26.87 
 
 		 597 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  31.08 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2894  sterol desaturase-related protein  31.16 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  28.38 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  26.42 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  30.56 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3171  sterol desaturase-related protein  29.71 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.0471796 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  30.56 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3860  hypothetical protein  26.49 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  29.86 
 
 		 325 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  25.93 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  25.22 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  28.34 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  30 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  27.04 
 
 		 304 aa  67  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  30.81 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  31.84 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46520  hypothetical protein  29.21 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  29.21 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  28.57 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  27.14 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  29.87 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2296  fatty acid hydroxylase  32.09 
 
 		 374 aa  65.9  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152596 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  27.78 
 
 		 324 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0281  fatty acid hydroxylase  28.65 
 
 		 314 aa  65.5  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  27.78 
 
 		 324 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  29.59 
 
 		 400 aa  65.5  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  27.22 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  27.1 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  26.59 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  27.63 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  27.92 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  28.76 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  31.29 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  26.71 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  26.97 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  26.59 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  26.97 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  26.97 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  33.52 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>