233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0689 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0689  sterol desaturase-like protein  100 
 
 
284 aa  570  1e-161  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  40.48 
 
 
325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  27.78 
 
 
336 aa  106  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  32.02 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  28.85 
 
 
281 aa  79.7  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  26.42 
 
 
304 aa  77  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  33.54 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  28.31 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  29.27 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  30.29 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  30.52 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  30.52 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  29.59 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  29.87 
 
 
385 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  28 
 
 
386 aa  68.9  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  30.94 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  29.65 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  27.43 
 
 
304 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  30.18 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  30.18 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  30.18 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  30.43 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  27.93 
 
 
307 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  27.71 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  30.18 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  30.46 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  32.89 
 
 
279 aa  67  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  28.64 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  31.9 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  25.57 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  26.82 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  28.98 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  26.34 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  24.71 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0371  putative transmembrane fatty acid synthesis protein  29.89 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  27.78 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  26.92 
 
 
330 aa  65.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  26.92 
 
 
330 aa  65.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  30.06 
 
 
272 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  25.57 
 
 
297 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5467  hypothetical protein  30.46 
 
 
411 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189673  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  24.43 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  29.24 
 
 
259 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  25.54 
 
 
626 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  33.12 
 
 
291 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  26.37 
 
 
304 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  29.68 
 
 
267 aa  63.5  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  31.72 
 
 
273 aa  63.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  27.39 
 
 
284 aa  63.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  23.08 
 
 
328 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  24.87 
 
 
320 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  24.29 
 
 
408 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  29.86 
 
 
273 aa  63.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  24.89 
 
 
304 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  29.48 
 
 
267 aa  63.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  31.25 
 
 
272 aa  62.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  26.37 
 
 
304 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  31.91 
 
 
276 aa  62.8  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  26.79 
 
 
258 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  27.37 
 
 
321 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  30.34 
 
 
282 aa  62.8  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  25.14 
 
 
287 aa  62.4  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  25.71 
 
 
287 aa  62.4  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  25.14 
 
 
402 aa  62.4  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3695  fatty acid hydroxylase  25.6 
 
 
298 aa  62.4  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00011612  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  28.25 
 
 
270 aa  62.4  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  26.14 
 
 
288 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  29.53 
 
 
278 aa  61.6  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  28.85 
 
 
276 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  24.86 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  30.46 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  29.73 
 
 
272 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  27.06 
 
 
413 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  25.95 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  28.74 
 
 
430 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  25.57 
 
 
288 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  25.57 
 
 
288 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1096  fatty acid hydroxylase  25.29 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.354603  normal  0.159739 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  26.75 
 
 
282 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5310  fatty acid hydroxylase  28.16 
 
 
293 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000145361  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  26.79 
 
 
339 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  25.28 
 
 
288 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  26.29 
 
 
287 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  27.59 
 
 
331 aa  60.8  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  25.41 
 
 
304 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  25.71 
 
 
287 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  28.97 
 
 
270 aa  60.1  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  26.09 
 
 
597 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4648  sterol desaturase-like protein  26.42 
 
 
356 aa  60.1  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  28.24 
 
 
284 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3822  hypothetical protein  23.98 
 
 
284 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  30.46 
 
 
264 aa  59.7  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  25.41 
 
 
304 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  25.39 
 
 
285 aa  59.7  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  25.41 
 
 
304 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2304  fatty acid hydroxylase  26.88 
 
 
298 aa  59.3  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  31.11 
 
 
327 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  27.64 
 
 
328 aa  59.3  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  28.49 
 
 
323 aa  58.9  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  25.95 
 
 
597 aa  59.3  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>