216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5310 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5310  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
293 aa  601  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000145361  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4507  fatty acid hydroxylase  77.89 
 
 
373 aa  488  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4648  sterol desaturase-like protein  66.33 
 
 
356 aa  418  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2772  putative sterol desaturase  39.31 
 
 
297 aa  211  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.788524  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00757  sterol desaturase family protein, putative  37.4 
 
 
315 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1471  fatty acid hydroxylase  41.18 
 
 
300 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.543581  normal  0.072759 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1430  fatty acid hydroxylase  38.64 
 
 
300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0718687  normal  0.0549932 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  29.83 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  29.53 
 
 
376 aa  79  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  30.36 
 
 
322 aa  77  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  29.28 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  30.48 
 
 
279 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  29.28 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  29.28 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  29.28 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  29.28 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  29.28 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  30.94 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  28.8 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  28.83 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  31.61 
 
 
304 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  24.42 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  28.22 
 
 
324 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  31.4 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  32.2 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  30.66 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  31.4 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  31.4 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  31.64 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  31.64 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  29.88 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  27.5 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  30.46 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  29.56 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  27.5 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  27.5 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  27.37 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  27.37 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  31.63 
 
 
407 aa  69.7  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  27.53 
 
 
324 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  27.43 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  27.37 
 
 
324 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2332  hypothetical protein  29.24 
 
 
304 aa  68.9  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  29.09 
 
 
320 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1631  hypothetical protein  29.89 
 
 
312 aa  68.9  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.305969 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  27.5 
 
 
301 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  29.09 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  32.69 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  29.89 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  29.41 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  27.46 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  30.57 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  29.35 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  29.59 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  32.3 
 
 
304 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3502  fatty acid hydroxylase  28.36 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0956724 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  30.29 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  26.54 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  27.65 
 
 
386 aa  66.2  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  29.11 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  29.3 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  29.75 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  26.74 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  29.94 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  25.97 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  24.7 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  28.85 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  25.62 
 
 
285 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  29.3 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  27.5 
 
 
305 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  28.24 
 
 
304 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  29.3 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  26.7 
 
 
376 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  27.61 
 
 
324 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3177  fatty acid hydroxylase  28.36 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0075  fatty acid hydroxylase  23.39 
 
 
324 aa  64.3  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145627 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  25.88 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  25.22 
 
 
292 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  27.61 
 
 
324 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  28.23 
 
 
276 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  31.25 
 
 
218 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  31.25 
 
 
218 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  26.82 
 
 
325 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  27.65 
 
 
287 aa  63.5  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  27.44 
 
 
327 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  25.31 
 
 
274 aa  63.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  26.67 
 
 
291 aa  62.8  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5174  fatty acid hydroxylase  34.67 
 
 
291 aa  62.4  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  25.15 
 
 
324 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  25.54 
 
 
400 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  28.77 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  27.93 
 
 
401 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  27.71 
 
 
307 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3860  hypothetical protein  29.65 
 
 
314 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  30.39 
 
 
374 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  27.93 
 
 
401 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1221  fatty acid hydroxylase  26.22 
 
 
301 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.387146  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  25 
 
 
400 aa  60.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3145  hypothetical protein  30 
 
 
297 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.168968  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0469  sterol desaturase-related protein  28.65 
 
 
343 aa  60.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.93302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>