168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2772 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2772  putative sterol desaturase  100 
 
 		 297 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.788524  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1471  fatty acid hydroxylase  72.88 
 
 		 300 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.543581  normal  0.072759 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1430  fatty acid hydroxylase  71.86 
 
 		 300 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0718687  normal  0.0549932 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00757  sterol desaturase family protein, putative  49.81 
 
 		 315 aa  263  4e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4507  fatty acid hydroxylase  41.03 
 
 		 373 aa  217  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5310  fatty acid hydroxylase  39.31 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000145361  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4648  sterol desaturase-like protein  36.88 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  28.22 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  27.51 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  30.94 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  31.84 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1096  fatty acid hydroxylase  27.43 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.354603  normal  0.159739 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  30.49 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  30.04 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  31.34 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  30.94 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  30.94 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  30.94 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  29.24 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  32.67 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  31.25 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  31.61 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  25.53 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  30.97 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  26.85 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  29.51 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  32.4 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  30.39 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  31.25 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  29.15 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  31.15 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  28.86 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  31.84 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  31.84 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  30.29 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  27.65 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  33.55 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  26.25 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  25.13 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  31.13 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  27.24 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  33.12 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1631  hypothetical protein  26.9 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.305969 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  28.96 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  27.8 
 
 		 386 aa  59.3  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  28.96 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  28.96 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  27.92 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  32.48 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  30.13 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  30.13 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  27.39 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  25.57 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  28.41 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  33.13 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  26.96 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  27.6 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  27.24 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  28.74 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  29.69 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  29.68 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  30.32 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  27.89 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  27.89 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  27.89 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  27.95 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  27.43 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  34.1 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  27.43 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6122  fatty acid hydroxylase  24.72 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2296  fatty acid hydroxylase  32.69 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152596 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  30.32 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  30.32 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  30.32 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  29.68 
 
 		 304 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  27.4 
 
 		 267 aa  57  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  29.41 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  27.06 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3780  fatty acid hydroxylase  26.77 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  28.5 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  28.5 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2079  hypothetical protein  29.73 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.768511  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  27.67 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  28.12 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0469  sterol desaturase-related protein  27.39 
 
 		 343 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.93302 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0689  sterol desaturase-like protein  28.9 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3822  hypothetical protein  29.02 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1221  hypothetical protein  27.11 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31242  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  28.89 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  28.49 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  29.29 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3502  fatty acid hydroxylase  27.75 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0956724 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  27.42 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  27.84 
 
 		 377 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3177  fatty acid hydroxylase  27.75 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  29.65 
 
 		 332 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  25.41 
 
 		 264 aa  53.5  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3610  fatty acid hydroxylase  28 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  30 
 
 		 218 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  30 
 
 		 218 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>