160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1471 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1471  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 300 aa  617  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.543581  normal  0.072759 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1430  fatty acid hydroxylase  97 
 
 		 300 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0718687  normal  0.0549932 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2772  putative sterol desaturase  72.88 
 
 		 297 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.788524  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00757  sterol desaturase family protein, putative  51.7 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4507  fatty acid hydroxylase  40.43 
 
 		 373 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4648  sterol desaturase-like protein  41.06 
 
 		 356 aa  206  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5310  fatty acid hydroxylase  41.18 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000145361  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  26.45 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  31.11 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  30.13 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  29 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  27.73 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  30.46 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  29.44 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  29.77 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  31.17 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  29.8 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  32.47 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  29 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  28.83 
 
 		 407 aa  58.9  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  32.18 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  30.46 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  30.23 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  27.91 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  29.65 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  29.65 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  28.85 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  25.48 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  30.67 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  27.46 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  30.77 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  30.67 
 
 		 288 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  28.79 
 
 		 327 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  30 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  30.67 
 
 		 288 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  28.85 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  28.79 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  30.86 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  33.77 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  31.67 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  28.21 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  24.32 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3171  sterol desaturase-related protein  27.62 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.0471796 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3822  hypothetical protein  31.41 
 
 		 284 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  28.85 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  30 
 
 		 287 aa  54.7  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  33.33 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  25 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1221  hypothetical protein  29.03 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31242  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1096  fatty acid hydroxylase  25.3 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.354603  normal  0.159739 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  25.76 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  24.42 
 
 		 264 aa  54.3  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  29.65 
 
 		 267 aa  53.5  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  26.95 
 
 		 324 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1631  hypothetical protein  26.59 
 
 		 312 aa  53.1  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.305969 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  28.18 
 
 		 308 aa  53.1  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  30.5 
 
 		 256 aa  53.5  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  28.21 
 
 		 303 aa  52.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  27.67 
 
 		 258 aa  53.1  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3418  sterol desaturase-related protein  27.62 
 
 		 306 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0225552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2296  fatty acid hydroxylase  31.37 
 
 		 374 aa  52.8  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152596 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11844  membrane-bound C-5 sterol desaturase erg3 (sterol-c5-desaturase)  25.1 
 
 		 314 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  26.58 
 
 		 402 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  30.54 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  27.56 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  27.78 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  26.15 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  28 
 
 		 386 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  26.15 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  30.46 
 
 		 256 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  28.74 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  27.56 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  27.78 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  27.56 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  27.78 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  26.15 
 
 		 324 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  32.1 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  29.23 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  29.23 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  27.27 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  27.27 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  29.21 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  27.27 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  27.17 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  26.59 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  28.28 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  28.66 
 
 		 336 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  27.81 
 
 		 218 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  27.81 
 
 		 218 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06935  hypothetical protein  28.57 
 
 		 316 aa  50.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  32.57 
 
 		 374 aa  50.4  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  30.06 
 
 		 331 aa  50.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  28.66 
 
 		 307 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0469  sterol desaturase-related protein  26.06 
 
 		 343 aa  50.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.93302 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0689  sterol desaturase-like protein  26.51 
 
 		 284 aa  49.7  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3695  fatty acid hydroxylase  22.04 
 
 		 298 aa  49.7  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00011612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  29.29 
 
 		 373 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2864  sterol desaturase-related protein  28.64 
 
 		 312 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2908  sterol desaturase-related protein  28.64 
 
 		 312 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2894  sterol desaturase-related protein  28.64 
 
 		 312 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>