220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4648 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4648  sterol desaturase-like protein  100 
 
 
356 aa  727    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4507  fatty acid hydroxylase  65.03 
 
 
373 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5310  fatty acid hydroxylase  66.33 
 
 
293 aa  418  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000145361  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2772  putative sterol desaturase  36.88 
 
 
297 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.788524  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1471  fatty acid hydroxylase  41.06 
 
 
300 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.543581  normal  0.072759 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1430  fatty acid hydroxylase  40.65 
 
 
300 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0718687  normal  0.0549932 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00757  sterol desaturase family protein, putative  36.26 
 
 
315 aa  199  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  30.32 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  31.64 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  29.49 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  32.35 
 
 
374 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  32.3 
 
 
279 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  29.61 
 
 
407 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  29.94 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  31.87 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  27.07 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  31.67 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  31.67 
 
 
373 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  31.67 
 
 
374 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  29.52 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  32.22 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  25.9 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  27.1 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  29.79 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  28.09 
 
 
324 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  29.73 
 
 
320 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  30.51 
 
 
324 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  24.28 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  24.28 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  24.28 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  28.04 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  24.28 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  28.65 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  30.2 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  28.04 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  28.96 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  24.28 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  24.28 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  29.45 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  28.11 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  27.95 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  30.07 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  28.14 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  28.22 
 
 
324 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  27.03 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0469  sterol desaturase-related protein  25.4 
 
 
343 aa  67  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.93302 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  27.03 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  27.12 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  26.69 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  29.41 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  29.41 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  28.57 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  30.13 
 
 
319 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  25.82 
 
 
400 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  25.28 
 
 
327 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  29.22 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  28.29 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  25.41 
 
 
400 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  29.09 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  30.13 
 
 
287 aa  65.1  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  28.1 
 
 
288 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  25.83 
 
 
380 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  28.76 
 
 
288 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  22.63 
 
 
332 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  28 
 
 
325 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  26.59 
 
 
303 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  28.76 
 
 
288 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  25.28 
 
 
332 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  30 
 
 
374 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  27.33 
 
 
304 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  30.2 
 
 
270 aa  63.9  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  31.87 
 
 
407 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  28.05 
 
 
374 aa  63.2  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  30.82 
 
 
289 aa  63.2  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  26.59 
 
 
305 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  26.62 
 
 
285 aa  63.2  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  27 
 
 
270 aa  63.2  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  26.59 
 
 
305 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  26.59 
 
 
305 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  26.32 
 
 
272 aa  62.8  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  28.03 
 
 
264 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  30.77 
 
 
431 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  29.22 
 
 
431 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6146  fatty acid hydroxylase  25.23 
 
 
337 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  26.89 
 
 
267 aa  62.4  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  28.03 
 
 
287 aa  62.4  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  25.13 
 
 
258 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  31.36 
 
 
426 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  26.97 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5174  fatty acid hydroxylase  30.34 
 
 
291 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  30.07 
 
 
431 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  27.22 
 
 
597 aa  62  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  31.25 
 
 
293 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0281  fatty acid hydroxylase  28.39 
 
 
314 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  27.45 
 
 
408 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  26.58 
 
 
264 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  27.27 
 
 
271 aa  61.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2901  fatty acid hydroxylase  27.71 
 
 
326 aa  61.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800123  normal  0.025383 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3502  fatty acid hydroxylase  29.24 
 
 
309 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0956724 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  26.97 
 
 
304 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>