172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00757 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00757  sterol desaturase family protein, putative  100 
 
 		 315 aa  653    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2772  putative sterol desaturase  49.81 
 
 		 297 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.788524  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1471  fatty acid hydroxylase  51.7 
 
 		 300 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.543581  normal  0.072759 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1430  fatty acid hydroxylase  52.08 
 
 		 300 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0718687  normal  0.0549932 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5310  fatty acid hydroxylase  37.4 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000145361  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4507  fatty acid hydroxylase  36.88 
 
 		 373 aa  201  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4648  sterol desaturase-like protein  36.26 
 
 		 356 aa  199  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  27.27 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  29.52 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  26.02 
 
 		 407 aa  67  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  26.52 
 
 		 308 aa  67  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  28.69 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  28.65 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  30.72 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  31.98 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1631  hypothetical protein  25.77 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.305969 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  29.94 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  31.07 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  27.27 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  25.73 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  29.01 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  29.59 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  29.45 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  26.59 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  26.59 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  26.59 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  27.22 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  30.23 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  28.4 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  26.67 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  28.57 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  26.67 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  26.59 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  26.59 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  26.59 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  26.71 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  28.05 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  28.66 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  29.65 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  29.65 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  29.53 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  25 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  25.95 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  26.47 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06935  hypothetical protein  26.47 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  29.53 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  29.33 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  29.53 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  28.86 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  25.3 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  27.44 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  27.54 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  27.92 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  27.92 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  29.76 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  27.54 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  27.61 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  28.72 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  28.4 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  29.27 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  28.86 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  25.95 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  29.17 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  27.22 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  26 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1096  fatty acid hydroxylase  27.04 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.354603  normal  0.159739 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  30.67 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  26.7 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0281  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 		 314 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  28 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  28.32 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  26.98 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3780  fatty acid hydroxylase  23.33 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5174  fatty acid hydroxylase  30.91 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  25.98 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46520  hypothetical protein  27.72 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374857  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  26.67 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  27.43 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  25.75 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  27.43 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  27.43 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  27.45 
 
 		 374 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  27.45 
 
 		 373 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  30.64 
 
 		 626 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  26 
 
 		 339 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  29.61 
 
 		 374 aa  53.9  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  27.45 
 
 		 373 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  27.38 
 
 		 304 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  24.51 
 
 		 281 aa  53.5  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  27.33 
 
 		 303 aa  53.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  26.8 
 
 		 291 aa  53.5  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  25.52 
 
 		 380 aa  53.5  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  29.38 
 
 		 597 aa  53.5  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  26.9 
 
 		 218 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  26.9 
 
 		 218 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  27.45 
 
 		 301 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  26.87 
 
 		 293 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  29.38 
 
 		 597 aa  53.5  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  28.48 
 
 		 304 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3610  fatty acid hydroxylase  27.49 
 
 		 317 aa  52.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>