238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2190 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  99.69 
 
 		 324 aa  664    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  95.37 
 
 		 324 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  94.44 
 
 		 325 aa  642    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  100 
 
 		 324 aa  664    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  95.37 
 
 		 324 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  95.37 
 
 		 324 aa  639    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  91.67 
 
 		 324 aa  622  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  83.9 
 
 		 329 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  83.9 
 
 		 329 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  83.9 
 
 		 329 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  83.59 
 
 		 329 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  83.59 
 
 		 329 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  83.59 
 
 		 329 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  82.62 
 
 		 329 aa  570  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  71.25 
 
 		 332 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  71.87 
 
 		 332 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  72.48 
 
 		 327 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1629  fatty acid hydroxylase  50.62 
 
 		 324 aa  323  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0812703  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  47.66 
 
 		 331 aa  315  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  49.36 
 
 		 324 aa  305  6e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  46.65 
 
 		 320 aa  305  9.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  47.74 
 
 		 321 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  47.28 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  47 
 
 		 326 aa  299  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2062  transmembrane protein  46.89 
 
 		 324 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  49.06 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2079  hypothetical protein  48.46 
 
 		 324 aa  290  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.768511  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  49.04 
 
 		 324 aa  287  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  45.31 
 
 		 331 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1106  fatty acid hydroxylase  45.94 
 
 		 332 aa  265  7e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1186  hypothetical protein  45.31 
 
 		 332 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.502028 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  40.57 
 
 		 323 aa  258  9e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  40.66 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0075  fatty acid hydroxylase  38.77 
 
 		 324 aa  226  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2296  fatty acid hydroxylase  40.56 
 
 		 374 aa  195  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152596 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  35.77 
 
 		 297 aa  175  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  32.87 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  30.19 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1074  fatty acid hydroxylase  30.63 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  29.9 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  30.14 
 
 		 374 aa  75.9  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  27.14 
 
 		 376 aa  75.9  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  32.16 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  32.47 
 
 		 270 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  28.75 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  28.22 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  32.88 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  27.3 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  28.92 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  30.43 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  29.88 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  30.56 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  30.07 
 
 		 374 aa  72.4  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  32.34 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  26.15 
 
 		 401 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  26.15 
 
 		 401 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  39.29 
 
 		 597 aa  72  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  29.52 
 
 		 283 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  39.29 
 
 		 597 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  26.15 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  30.43 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  25.93 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  31.97 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  30.43 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  30.87 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  29.27 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  22.78 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  28.46 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  27.65 
 
 		 273 aa  68.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  28.75 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  31.21 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  26.47 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  32.73 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  28.99 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  32.87 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  30.82 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  26.62 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  30.32 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  34.31 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  32.12 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  31.58 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  31.58 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  30.92 
 
 		 431 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  29.53 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  26.95 
 
 		 400 aa  66.2  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  28.87 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  30.92 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  29.37 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  26.35 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  26.88 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  28.3 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4274  hypothetical protein  31.61 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  28.85 
 
 		 276 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  28.09 
 
 		 626 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  27.78 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  26.46 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  21.93 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>