249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1574 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  100 
 
 
264 aa  522  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  87.83 
 
 
264 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  65.06 
 
 
258 aa  321  7e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  60.47 
 
 
257 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  33.71 
 
 
284 aa  149  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  34.82 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1077  hypothetical protein  34.84 
 
 
220 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  32.78 
 
 
274 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  37.91 
 
 
270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  36.59 
 
 
295 aa  132  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  31.36 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  35.07 
 
 
279 aa  125  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  35.79 
 
 
272 aa  124  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  32.42 
 
 
273 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  29.25 
 
 
267 aa  123  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  35.63 
 
 
278 aa  123  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  30.86 
 
 
330 aa  122  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  30.86 
 
 
330 aa  122  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  33.91 
 
 
283 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  36.21 
 
 
256 aa  122  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  31.62 
 
 
278 aa  122  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  31.05 
 
 
304 aa  122  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  34.71 
 
 
273 aa  122  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  44.29 
 
 
337 aa  119  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  37.17 
 
 
268 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  33.68 
 
 
267 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  33.8 
 
 
270 aa  120  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  35.06 
 
 
256 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  37.65 
 
 
272 aa  119  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  36.76 
 
 
283 aa  119  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  37.42 
 
 
282 aa  118  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  37.43 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  37.43 
 
 
289 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  32.09 
 
 
288 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  35.76 
 
 
292 aa  115  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  35.54 
 
 
287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  36.84 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  34.73 
 
 
272 aa  113  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  32.98 
 
 
270 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  35.63 
 
 
265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  29.88 
 
 
264 aa  109  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  31.03 
 
 
291 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  33.53 
 
 
328 aa  91.3  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  30 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  28.91 
 
 
385 aa  89.4  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  27.44 
 
 
293 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  32.21 
 
 
376 aa  85.5  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  28.11 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  28.11 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  36.43 
 
 
380 aa  84.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  37.24 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  31.43 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  31.36 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  35.61 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  35.61 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  35.61 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  35.61 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  30.56 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  37.16 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39990  hypothetical protein  32.58 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  31.3 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3388  hypothetical protein  34.19 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0628245  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  27.78 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  28.66 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2751  hypothetical protein  36.15 
 
 
240 aa  77  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  28.22 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  27.88 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  31.85 
 
 
407 aa  76.3  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  32.43 
 
 
376 aa  75.5  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  24.9 
 
 
256 aa  75.1  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  33.79 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  30.07 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  29.89 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2296  fatty acid hydroxylase  26.79 
 
 
374 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152596 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  26.63 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  32.24 
 
 
431 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  31.58 
 
 
431 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  26.86 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  30.99 
 
 
374 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  26.99 
 
 
315 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  29.41 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  33.11 
 
 
431 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  33.1 
 
 
386 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  30 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  30.92 
 
 
431 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  27.85 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0951  hypothetical protein  30.91 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  29.37 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  22.78 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  22.78 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  34.04 
 
 
597 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  32.41 
 
 
400 aa  69.7  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  28.67 
 
 
400 aa  69.3  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2332  hypothetical protein  26.97 
 
 
304 aa  68.9  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  28.43 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11844  membrane-bound C-5 sterol desaturase erg3 (sterol-c5-desaturase)  29.03 
 
 
314 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  27.15 
 
 
314 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  22.78 
 
 
325 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  33.33 
 
 
597 aa  68.6  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  29.63 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>