213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4507 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4507  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 373 aa  764    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5310  fatty acid hydroxylase  77.89 
 
 		 293 aa  490  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000145361  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4648  sterol desaturase-like protein  60.55 
 
 		 356 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2772  putative sterol desaturase  41.03 
 
 		 297 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.788524  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1430  fatty acid hydroxylase  40.21 
 
 		 300 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0718687  normal  0.0549932 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1471  fatty acid hydroxylase  40.43 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.543581  normal  0.072759 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00757  sterol desaturase family protein, putative  36.88 
 
 		 315 aa  202  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  27.83 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  28.02 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  29.71 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  30.69 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  30 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  28.8 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  29.59 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  26.97 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  29.59 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  28.16 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  30.11 
 
 		 324 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  27.51 
 
 		 322 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  28.26 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  29.51 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  28.26 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  26 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  30.86 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  28.26 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  30.49 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  28.49 
 
 		 305 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  28.26 
 
 		 329 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  28.16 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  28.16 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  28.26 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  28.26 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  28.49 
 
 		 305 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  28.26 
 
 		 329 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  28.49 
 
 		 305 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  28.26 
 
 		 329 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  28.26 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  27.89 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  28.16 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  29.67 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  30.63 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  27.89 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  27.89 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  28.64 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2332  hypothetical protein  29.71 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1631  hypothetical protein  30.77 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.305969 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  27.59 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  28.89 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  28.89 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  28.91 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  24.34 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  27.56 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  30.06 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  28.89 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  34.38 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  27.91 
 
 		 303 aa  67  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  25.22 
 
 		 331 aa  67  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  30.16 
 
 		 281 aa  67  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  27.59 
 
 		 287 aa  67  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0469  sterol desaturase-related protein  29.59 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.93302 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  27.39 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  27.47 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  27.09 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  28.89 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  27.65 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  25.41 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  27.37 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  25.63 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  28.18 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  26.84 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  26.84 
 
 		 288 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  26.84 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  26.84 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  26.84 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  29.45 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  26.83 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  29.41 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  27.87 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  27.32 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  27.87 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  27.32 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  27.42 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  26.86 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  28.37 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  27.54 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  27.22 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  24.75 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  29.17 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  27.61 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  27.61 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  26.44 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2296  fatty acid hydroxylase  26.56 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152596 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  28.97 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  32.94 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  31.17 
 
 		 431 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  26.44 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  30 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6122  fatty acid hydroxylase  27.95 
 
 		 290 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3860  hypothetical protein  29.56 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  29.45 
 
 		 258 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>