209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0001 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0075  fatty acid hydroxylase  50.7 
 
 		 324 aa  299  3e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145627 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  44.13 
 
 		 308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  37.75 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  36.86 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  36.86 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  36.86 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  36.5 
 
 		 332 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  35.4 
 
 		 332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  35.88 
 
 		 324 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  34.92 
 
 		 329 aa  182  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  36.5 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  36.36 
 
 		 329 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  36.36 
 
 		 329 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  36.36 
 
 		 329 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  35.51 
 
 		 324 aa  178  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  36 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  36 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  36 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  34.67 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  35.77 
 
 		 324 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  35.77 
 
 		 324 aa  175  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  36.45 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2062  transmembrane protein  36.79 
 
 		 324 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  35.24 
 
 		 324 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1629  fatty acid hydroxylase  37.37 
 
 		 324 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0812703  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  36.79 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  38.31 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  36.14 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  36.39 
 
 		 321 aa  155  9e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  39.76 
 
 		 331 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1106  fatty acid hydroxylase  37.85 
 
 		 332 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2079  hypothetical protein  36.43 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.768511  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1186  hypothetical protein  38.25 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.502028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2296  fatty acid hydroxylase  39.25 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152596 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  31.76 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  32.24 
 
 		 267 aa  92  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  33.84 
 
 		 321 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  31.68 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  33.06 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  29.86 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  31.91 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  36.76 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  33.33 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  27.89 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  28.87 
 
 		 376 aa  72.4  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  29.55 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  28.74 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  32.26 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  34.51 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  31.65 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  33.55 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  35.25 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  35.25 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  34.29 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  28.86 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  32.86 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  34.53 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  34.53 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  34.53 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  34.53 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  29.79 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  33.81 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  29.79 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  31.91 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  30.06 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  34.53 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  28.37 
 
 		 295 aa  67  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  26.91 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  35.07 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  35.07 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  31.25 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  25.71 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  30.5 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  28.92 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  29.68 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  27.12 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  30.38 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  29.58 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  30.08 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  25.97 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  33.09 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  33.09 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  28.57 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  27.86 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  31.33 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  32.17 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  31.54 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  27.01 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4507  fatty acid hydroxylase  28.37 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  31.13 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  25.97 
 
 		 402 aa  62.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  29.85 
 
 		 373 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  29.85 
 
 		 373 aa  62.8  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  31.3 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  29.85 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  31.29 
 
 		 597 aa  62.4  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  27.57 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  26.09 
 
 		 401 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  29.85 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>