195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1106 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1106  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 332 aa  665    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1186  hypothetical protein  98.49 
 
 		 332 aa  655    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.502028 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  74.32 
 
 		 328 aa  508  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  69.63 
 
 		 326 aa  458  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  65.66 
 
 		 320 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1629  fatty acid hydroxylase  66.26 
 
 		 324 aa  441  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0812703  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  70.95 
 
 		 331 aa  443  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  63.88 
 
 		 321 aa  425  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2079  hypothetical protein  67.26 
 
 		 324 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.768511  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  55.87 
 
 		 331 aa  351  8e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  54.46 
 
 		 324 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  56.31 
 
 		 324 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  55.08 
 
 		 324 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2062  transmembrane protein  56.29 
 
 		 324 aa  332  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  45.32 
 
 		 332 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  46.97 
 
 		 327 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  46.56 
 
 		 325 aa  295  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  47.5 
 
 		 329 aa  295  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  47.5 
 
 		 329 aa  295  7e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  47.5 
 
 		 329 aa  295  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  47.81 
 
 		 329 aa  293  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  46.88 
 
 		 324 aa  292  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  45.94 
 
 		 324 aa  291  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  46.25 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  45.62 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  46.25 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  47.19 
 
 		 329 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  47.19 
 
 		 329 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  45.94 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  47.19 
 
 		 329 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  45.32 
 
 		 332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  39.27 
 
 		 323 aa  251  9.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  38.51 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0075  fatty acid hydroxylase  37.82 
 
 		 324 aa  202  5e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2296  fatty acid hydroxylase  39.22 
 
 		 374 aa  172  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152596 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  37.09 
 
 		 297 aa  165  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  29.75 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  31.52 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  30.88 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  33.51 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  30.98 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  29.61 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  28.52 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  31.9 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  27.69 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  31.4 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  27.36 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  26.55 
 
 		 274 aa  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  29.05 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  29.27 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  25.48 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  29.1 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  26.6 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  24.41 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  28.83 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  26.01 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  25.64 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  25.93 
 
 		 413 aa  62.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  25.52 
 
 		 380 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  30.72 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  30.81 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  27.56 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  28.92 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  29.07 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  25.17 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  25.93 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  25.93 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  25.73 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  24.07 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  27.67 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  26.63 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  27.17 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  27.17 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  29.81 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2772  putative sterol desaturase  28.16 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.788524  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  29.48 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  29.22 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  24.86 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  27.17 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3822  hypothetical protein  29.8 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  27.84 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  23.96 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  27.17 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  27.99 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  24.49 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  26.92 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  27.95 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  29.09 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  25.5 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  30.97 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  26.75 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2304  fatty acid hydroxylase  28.65 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  28.24 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  27.07 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  28.48 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  25.74 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  28.66 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  26.76 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  24.37 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>