236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7771 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
284 aa  586  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  37.67 
 
 
281 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  35.71 
 
 
376 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  34.73 
 
 
374 aa  99.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  31.9 
 
 
401 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  31.9 
 
 
401 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  33.17 
 
 
385 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  33.33 
 
 
376 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  33.52 
 
 
288 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  29.89 
 
 
291 aa  87  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5741  hypothetical protein  32.78 
 
 
320 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  30.12 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  30.12 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  30.12 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  32.22 
 
 
386 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  30.12 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  31.53 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  31.53 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  31.53 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  31.53 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1629  fatty acid hydroxylase  29.5 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0812703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  31.53 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  31.53 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  31.53 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  31.58 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  32.05 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  33.72 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  32.22 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  31.07 
 
 
326 aa  79.7  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  31.54 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  29.95 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  30.12 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  31.03 
 
 
324 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  31.03 
 
 
324 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  30.46 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  32.89 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  32.89 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  31.03 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  32.89 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  31.58 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  32.22 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  29.9 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  32.21 
 
 
288 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  32.21 
 
 
288 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  30.05 
 
 
325 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  29.9 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  32.21 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  31.54 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  30.11 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  30.2 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  31.58 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4555  hypothetical protein  27.6 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  27.82 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  30.12 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5286  hypothetical protein  29.41 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.789525  normal  0.137555 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  29.94 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5722  hypothetical protein  29.41 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2304  fatty acid hydroxylase  30.64 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  28.63 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  27.36 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4434  fatty acid hydroxylase  29.11 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00391015  normal  0.0114256 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1433  hypothetical protein  31.05 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  30.87 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1451  hypothetical protein  31.05 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  27.2 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  30.57 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  32.12 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  27.2 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  27.2 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  29.76 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  29.78 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  30.3 
 
 
315 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  24.24 
 
 
293 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5395  fatty acid hydroxylase  29.89 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  29.17 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  30.86 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  29.17 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  29.17 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  29.76 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0321  fatty acid hydroxylase  30.91 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  26.74 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  25.97 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  28.51 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3683  hypothetical protein  29.51 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5691  hypothetical protein  28.65 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.460531 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  29.38 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  28.96 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  28.96 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5320  hypothetical protein  28.65 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.573782 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  28.65 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  30 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  27.17 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0075  fatty acid hydroxylase  28.81 
 
 
324 aa  68.9  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145627 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  28.38 
 
 
312 aa  68.9  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  25.58 
 
 
332 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  32.74 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  29.67 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  30.46 
 
 
400 aa  68.9  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  29.53 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  28.95 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>