195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5395 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5395  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
295 aa  590  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4555  hypothetical protein  71.73 
 
 
318 aa  421  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5741  hypothetical protein  69.1 
 
 
320 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4434  fatty acid hydroxylase  72.82 
 
 
303 aa  401  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00391015  normal  0.0114256 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1433  hypothetical protein  69.1 
 
 
324 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5722  hypothetical protein  68.46 
 
 
323 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1451  hypothetical protein  69.1 
 
 
324 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5286  hypothetical protein  68.46 
 
 
323 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.789525  normal  0.137555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3683  hypothetical protein  68.15 
 
 
322 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5691  hypothetical protein  68.75 
 
 
322 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.460531 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5320  hypothetical protein  68.75 
 
 
322 aa  381  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.573782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  61.97 
 
 
305 aa  347  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  53.05 
 
 
284 aa  301  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2304  fatty acid hydroxylase  57.14 
 
 
298 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  52.26 
 
 
269 aa  277  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2374  fatty acid hydroxylase  55.35 
 
 
296 aa  254  9e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00297557  normal  0.604187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3298  fatty acid hydroxylase  53.26 
 
 
293 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55230  hypothetical protein  49.1 
 
 
301 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.226286  hitchhiker  0.000000221588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4808  hypothetical protein  47.7 
 
 
305 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0507867  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  38.14 
 
 
413 aa  163  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  40.26 
 
 
400 aa  145  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  29.14 
 
 
328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  31.01 
 
 
282 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  32.77 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  27.56 
 
 
401 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  27.56 
 
 
401 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  30.37 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  27.06 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  28.91 
 
 
374 aa  79.7  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  26.55 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  31.49 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  33.58 
 
 
376 aa  72.4  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  31.43 
 
 
380 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  26.82 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  33.57 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  33.57 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  33.57 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  33.57 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  28.73 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  29.61 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  28.66 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  32.14 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  31.11 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  26.11 
 
 
281 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  30.39 
 
 
287 aa  67  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  28.71 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  29.34 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  30.73 
 
 
377 aa  66.2  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  26.32 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  26.32 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  28.32 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  28.73 
 
 
291 aa  63.5  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  26.76 
 
 
279 aa  63.5  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  27.07 
 
 
265 aa  63.5  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  30.77 
 
 
374 aa  63.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  30.07 
 
 
374 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  25.67 
 
 
259 aa  60.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  25.79 
 
 
273 aa  60.1  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  28.38 
 
 
270 aa  60.1  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  25.97 
 
 
267 aa  59.7  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  31.2 
 
 
304 aa  59.7  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  25.3 
 
 
272 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  25.64 
 
 
272 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  29.71 
 
 
270 aa  58.5  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  26.23 
 
 
328 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  29.23 
 
 
304 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  29.55 
 
 
275 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  29.68 
 
 
274 aa  56.6  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  26.26 
 
 
278 aa  57  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  29.38 
 
 
295 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  29.45 
 
 
336 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  25.64 
 
 
270 aa  56.6  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  26.97 
 
 
292 aa  56.6  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  26.11 
 
 
256 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  27.94 
 
 
274 aa  56.2  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  27.69 
 
 
218 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  27.69 
 
 
218 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  25.14 
 
 
304 aa  56.2  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  28.46 
 
 
304 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  27.69 
 
 
303 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  28.35 
 
 
268 aa  55.8  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  27.15 
 
 
304 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  27.69 
 
 
305 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  27.69 
 
 
305 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  27.69 
 
 
305 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  26.92 
 
 
257 aa  55.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  29.23 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  29.23 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  25.34 
 
 
282 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  25.29 
 
 
320 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  27.08 
 
 
288 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  28.46 
 
 
304 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  25.45 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  27.08 
 
 
288 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  26.49 
 
 
304 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  25.1 
 
 
256 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  27.08 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  25.69 
 
 
284 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  27.08 
 
 
288 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  27.41 
 
 
304 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>