225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1439 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  661    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  73.39 
 
 
320 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  71.12 
 
 
326 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  71.82 
 
 
331 aa  471  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1106  fatty acid hydroxylase  74.32 
 
 
332 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1629  fatty acid hydroxylase  69.11 
 
 
324 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0812703  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1186  hypothetical protein  73.41 
 
 
332 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.502028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  66.36 
 
 
321 aa  450  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2079  hypothetical protein  67.07 
 
 
324 aa  422  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.768511  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  54.74 
 
 
324 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  56.13 
 
 
331 aa  358  5e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  55.66 
 
 
324 aa  351  8.999999999999999e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  55.52 
 
 
324 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2062  transmembrane protein  56.55 
 
 
324 aa  340  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  48.24 
 
 
325 aa  306  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  49.37 
 
 
329 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  49.37 
 
 
329 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  49.37 
 
 
329 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  47.24 
 
 
327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  48.73 
 
 
329 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  49.05 
 
 
329 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  49.05 
 
 
329 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  49.05 
 
 
329 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  47.28 
 
 
324 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  44.79 
 
 
332 aa  299  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  47.92 
 
 
324 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  46.96 
 
 
324 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  47.6 
 
 
324 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  47.6 
 
 
324 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  47.28 
 
 
324 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  44.79 
 
 
332 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  39.01 
 
 
323 aa  252  5.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  36.59 
 
 
308 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0075  fatty acid hydroxylase  37.62 
 
 
324 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145627 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  36.79 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2296  fatty acid hydroxylase  37.65 
 
 
374 aa  162  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152596 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  30.29 
 
 
291 aa  92  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  34.87 
 
 
321 aa  86.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  31.82 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  31.68 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  30.11 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  26.05 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  27.69 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  27.67 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  29.22 
 
 
256 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  27.96 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  30.72 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  28.74 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  26.54 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  32.28 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  30.11 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  26.92 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  29.14 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  27.07 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  30.86 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  29.03 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  30.11 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  29.55 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  28.27 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  28.27 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  28.27 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  29.14 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  31.79 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  29.87 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  31.03 
 
 
386 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  26.57 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  30 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  31.58 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  30.11 
 
 
293 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  31.37 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  28.27 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  28.75 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  25.31 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  30.32 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  29.19 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  28.8 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  25.31 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  25.31 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  26.69 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  25.87 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  28.36 
 
 
597 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  29.19 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  30.15 
 
 
322 aa  67  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  31.29 
 
 
304 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  31.18 
 
 
295 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  30.11 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  30.11 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  28.39 
 
 
315 aa  67  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  28 
 
 
597 aa  66.6  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  26.12 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  28.75 
 
 
426 aa  66.6  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  30.46 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  30.26 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  31.74 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  29.1 
 
 
282 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  27.92 
 
 
270 aa  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  23.46 
 
 
265 aa  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  31.15 
 
 
400 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  25.36 
 
 
401 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  25.36 
 
 
401 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>