255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1390 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  100 
 
 		 267 aa  547  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  54.89 
 
 		 304 aa  311  5.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  53.91 
 
 		 281 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  49.61 
 
 		 330 aa  272  5.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  49.61 
 
 		 330 aa  272  5.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  55.19 
 
 		 273 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  49.22 
 
 		 272 aa  263  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  50.79 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  46.06 
 
 		 295 aa  251  7e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  47.57 
 
 		 278 aa  251  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  51.05 
 
 		 283 aa  249  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  46.56 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  46.88 
 
 		 267 aa  240  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  45.42 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  46.97 
 
 		 273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  46.18 
 
 		 287 aa  238  6.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  43.56 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  47.45 
 
 		 259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  47.27 
 
 		 264 aa  232  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  44.4 
 
 		 268 aa  231  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  42.97 
 
 		 272 aa  222  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  43.28 
 
 		 270 aa  221  8e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  44.36 
 
 		 282 aa  215  7e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  41.41 
 
 		 279 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  42.58 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  39.62 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  43.22 
 
 		 270 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  27.84 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  32.95 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  31.52 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  29.76 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  30.32 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  32.55 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  29.34 
 
 		 289 aa  122  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  31.66 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  31.42 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  28.79 
 
 		 274 aa  120  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  30.58 
 
 		 289 aa  115  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  29.02 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  31.47 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  34.31 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  29.28 
 
 		 376 aa  102  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  34.4 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  34.48 
 
 		 374 aa  97.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  35.86 
 
 		 380 aa  95.9  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  31.13 
 
 		 321 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  28.11 
 
 		 376 aa  93.2  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  36.5 
 
 		 401 aa  92.4  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  36.5 
 
 		 401 aa  92.4  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  35.77 
 
 		 385 aa  91.3  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  33.79 
 
 		 301 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  34.93 
 
 		 373 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  34.93 
 
 		 374 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  34.93 
 
 		 373 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  30.77 
 
 		 626 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  27.93 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  25.96 
 
 		 597 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  29.84 
 
 		 288 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  25.53 
 
 		 597 aa  82  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  27.38 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  28.14 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3388  hypothetical protein  34.66 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0628245  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  28.93 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  33.77 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39990  hypothetical protein  34.09 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  27.6 
 
 		 386 aa  79  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  25 
 
 		 331 aa  79  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  32.97 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  26.59 
 
 		 291 aa  78.6  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  33.55 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2751  hypothetical protein  30.29 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  27.59 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  31.39 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  32.9 
 
 		 431 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  32.9 
 
 		 431 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  28.38 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0951  hypothetical protein  25.99 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1074  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  31.51 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5467  hypothetical protein  28.74 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189673  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  24.22 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  30.06 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  30.94 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4808  hypothetical protein  31.49 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0507867  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  29.86 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  31.21 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  29.53 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3502  fatty acid hydroxylase  31.85 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0956724 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  29.53 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3177  fatty acid hydroxylase  31.85 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  29.44 
 
 		 407 aa  72.4  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  27.08 
 
 		 329 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  33.33 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  27.08 
 
 		 329 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  27.08 
 
 		 329 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  27.08 
 
 		 329 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  27.08 
 
 		 329 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  27.08 
 
 		 329 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4807  fatty acid hydroxylase  29.55 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  25.39 
 
 		 269 aa  72  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>