255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1960 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  100 
 
 		 283 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  69.89 
 
 		 270 aa  393  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  65.56 
 
 		 278 aa  356  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  59.78 
 
 		 330 aa  331  7.000000000000001e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  59.78 
 
 		 330 aa  331  7.000000000000001e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  56.68 
 
 		 292 aa  325  6e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  62.18 
 
 		 287 aa  324  8.000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  58.4 
 
 		 256 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  60.62 
 
 		 267 aa  311  5.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  56.87 
 
 		 256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  57.04 
 
 		 282 aa  292  5e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  56.27 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  51.72 
 
 		 272 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  53.39 
 
 		 295 aa  271  9e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  49.63 
 
 		 281 aa  268  7e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  52.83 
 
 		 273 aa  255  6e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  51.18 
 
 		 304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  46.69 
 
 		 272 aa  253  3e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  48.31 
 
 		 267 aa  252  4.0000000000000004e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  50.39 
 
 		 268 aa  250  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  48.68 
 
 		 273 aa  250  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  45.49 
 
 		 279 aa  247  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  45.76 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  48.32 
 
 		 270 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  53.06 
 
 		 270 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  37.74 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  45.78 
 
 		 259 aa  195  7e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  37.56 
 
 		 283 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  34.73 
 
 		 284 aa  148  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  38.5 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  31.94 
 
 		 289 aa  143  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  32.17 
 
 		 274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  31.6 
 
 		 257 aa  135  7.000000000000001e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  34.29 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  34.31 
 
 		 264 aa  125  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  33.04 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  37.65 
 
 		 264 aa  124  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  37.65 
 
 		 278 aa  122  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  33.49 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  33.17 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  34.8 
 
 		 337 aa  102  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  30.73 
 
 		 376 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 		 321 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  27.9 
 
 		 386 aa  90.9  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  32.11 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  35.42 
 
 		 374 aa  90.5  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  28.68 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  29.95 
 
 		 401 aa  89  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  29.95 
 
 		 401 aa  89  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  28 
 
 		 380 aa  87.8  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  27.56 
 
 		 373 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 		 413 aa  86.7  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  28.15 
 
 		 385 aa  85.9  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  27.98 
 
 		 301 aa  85.9  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  27.56 
 
 		 373 aa  85.9  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  27.56 
 
 		 374 aa  85.9  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  30.39 
 
 		 275 aa  85.5  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  30.63 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  27.69 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  30.81 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  28.96 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  26.64 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  30.72 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39990  hypothetical protein  29.91 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  31.36 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  30.72 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  30.72 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  30.72 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  27.94 
 
 		 597 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  30.72 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  29.52 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  30.72 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  25.96 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  30.29 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1074  fatty acid hydroxylase  30.65 
 
 		 399 aa  79  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  30.09 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  31.36 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1629  fatty acid hydroxylase  27.96 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0812703  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3388  hypothetical protein  29.39 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0628245  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  29.44 
 
 		 597 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  30.12 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  34.18 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  27.78 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  30.19 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  27.54 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  33.8 
 
 		 374 aa  75.5  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4434  fatty acid hydroxylase  29.05 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00391015  normal  0.0114256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  28.99 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  32.39 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2751  hypothetical protein  27.88 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  28.92 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  29.9 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  27.55 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  31.87 
 
 		 626 aa  73.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2296  fatty acid hydroxylase  36.3 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152596 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  28.92 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  28.92 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  29.76 
 
 		 324 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  29.76 
 
 		 324 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>