221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2751 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2751  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  493  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1903  hypothetical protein  72.38 
 
 		 245 aa  368  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3388  hypothetical protein  55.75 
 
 		 255 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0628245  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39990  hypothetical protein  54.87 
 
 		 255 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0951  hypothetical protein  43.83 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4807  fatty acid hydroxylase  37.97 
 
 		 249 aa  175  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  33.19 
 
 		 526 aa  150  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  36.15 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  31.9 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  31.48 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  33.33 
 
 		 259 aa  75.1  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  32.88 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  32.48 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  36.15 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  28.57 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  29.31 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  27.88 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  30.05 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  33.33 
 
 		 278 aa  72  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  29.17 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  35.04 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  28.69 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  30 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  29.21 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  29.24 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  29.19 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  29.24 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  33.33 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  28.92 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  30.92 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  29.59 
 
 		 386 aa  67  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  28.92 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  29.5 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  28.92 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  31.85 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  29.85 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  28.5 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  31.91 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  32.34 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  27.37 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  28.49 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  30.06 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  28.42 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  31.03 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  29.17 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  32.61 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  30.49 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  31.33 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  27.84 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  27.84 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1631  hypothetical protein  29.21 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.305969 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  31.45 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  32.45 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  36.62 
 
 		 291 aa  62  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  31.85 
 
 		 297 aa  62  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  28.05 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  28.86 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  27.66 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  26.7 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  27.66 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  26.14 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  32.16 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  26.11 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  30.28 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  33.82 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  30.82 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4274  hypothetical protein  27.13 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  28.91 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  30.5 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  29.58 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  33.83 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  25.7 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  28.39 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  31.65 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  26.32 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  27.7 
 
 		 329 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  29.53 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  26.51 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  27.78 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  30 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2901  fatty acid hydroxylase  28.99 
 
 		 326 aa  58.5  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800123  normal  0.025383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  30.94 
 
 		 289 aa  58.5  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1629  fatty acid hydroxylase  27.92 
 
 		 324 aa  58.5  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0812703  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  31.72 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  32.86 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  30.99 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  29.79 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  32.86 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  31.97 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  30.41 
 
 		 339 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  28.57 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  27.37 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  28.82 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  30.14 
 
 		 597 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  26.71 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  26.71 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  26.71 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  26.71 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  26.71 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>