230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0045 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  589  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  35.95 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  33.94 
 
 
330 aa  116  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  33.94 
 
 
330 aa  116  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  35.91 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  35.86 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  33.49 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  34 
 
 
272 aa  110  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  32.72 
 
 
279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  32.99 
 
 
268 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  32.49 
 
 
273 aa  106  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  38.82 
 
 
267 aa  106  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  31.03 
 
 
264 aa  106  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  35.09 
 
 
270 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  30.8 
 
 
257 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  33.18 
 
 
273 aa  102  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  30.56 
 
 
265 aa  101  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  31.82 
 
 
264 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  35.71 
 
 
259 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  32.87 
 
 
287 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  31.77 
 
 
270 aa  99.8  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  29.21 
 
 
282 aa  99.4  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  30.53 
 
 
304 aa  99  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  26.27 
 
 
292 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  32.34 
 
 
278 aa  97.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  31.22 
 
 
281 aa  95.9  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  31.98 
 
 
284 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  31.11 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  34.4 
 
 
267 aa  94  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  31.65 
 
 
258 aa  92  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  36.36 
 
 
274 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  30.2 
 
 
264 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  29.18 
 
 
276 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  37.21 
 
 
337 aa  85.5  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  28.18 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  31.77 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  28.51 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  30.86 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  30.72 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  27.31 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  28.08 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  27.8 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  33.33 
 
 
431 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  33.33 
 
 
431 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  33.54 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  28.73 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  33.52 
 
 
431 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  32.1 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  33.91 
 
 
431 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  26.85 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3860  hypothetical protein  29.36 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6122  fatty acid hydroxylase  27.23 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  28.14 
 
 
295 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1294  fatty acid hydroxylase  26.89 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.443981 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  31.18 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  31.18 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  31.18 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  31.41 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  34.01 
 
 
282 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  30.41 
 
 
288 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0689  sterol desaturase-like protein  33.12 
 
 
284 aa  63.9  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  27.07 
 
 
315 aa  63.5  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  24.9 
 
 
626 aa  63.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  34.62 
 
 
320 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  31.79 
 
 
376 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  30.97 
 
 
328 aa  63.2  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  29.35 
 
 
304 aa  62.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  31.65 
 
 
407 aa  62.8  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  28.19 
 
 
400 aa  62.4  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  31.47 
 
 
374 aa  62.4  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  33.97 
 
 
321 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  25.68 
 
 
407 aa  62.4  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2751  hypothetical protein  36.62 
 
 
240 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  28.39 
 
 
400 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  30.32 
 
 
376 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  28.16 
 
 
288 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1096  fatty acid hydroxylase  25.74 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.354603  normal  0.159739 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 
281 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  26.04 
 
 
413 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  28.16 
 
 
288 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  27.76 
 
 
288 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  28.16 
 
 
288 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  28.65 
 
 
319 aa  59.7  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  32.65 
 
 
426 aa  59.7  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  29.53 
 
 
386 aa  59.3  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  25.53 
 
 
305 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  28.44 
 
 
336 aa  59.3  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  25.53 
 
 
305 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  25.53 
 
 
305 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  29.78 
 
 
430 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  30.91 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  30.82 
 
 
401 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  27.44 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  26.29 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  25.89 
 
 
322 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  27.14 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  30.54 
 
 
285 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  30.82 
 
 
401 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0951  hypothetical protein  32.31 
 
 
244 aa  58.9  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  30.13 
 
 
323 aa  58.9  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>