200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0827 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 289 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  91 
 
 		 289 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  51 
 
 		 283 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  39.92 
 
 		 274 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  33.21 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  36.14 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  36.14 
 
 		 256 aa  149  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  32.68 
 
 		 273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  34.55 
 
 		 283 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  34.5 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  33.6 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  34.14 
 
 		 256 aa  142  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  35.56 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  34.09 
 
 		 270 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  35.16 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  35.71 
 
 		 272 aa  136  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  32.34 
 
 		 330 aa  132  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  32.34 
 
 		 330 aa  132  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  32.27 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  34.19 
 
 		 270 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  32.82 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  42.2 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  32.69 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  33.59 
 
 		 272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  29.15 
 
 		 284 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  33.62 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  32.53 
 
 		 292 aa  122  8e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  38.95 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  34.82 
 
 		 287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  37.93 
 
 		 265 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  36.07 
 
 		 268 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  40 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  37.43 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  34.13 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  33.91 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  30.58 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  30.45 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  36.73 
 
 		 282 aa  108  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  39.51 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  33.54 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  95.9  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  29.31 
 
 		 336 aa  85.5  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  33.56 
 
 		 373 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  33.56 
 
 		 374 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  33.56 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  33.56 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  26.51 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  33.79 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  31.82 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  31.82 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  31.61 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  25.76 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  22.3 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  31.97 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  30.56 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  31.94 
 
 		 374 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  27.52 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  30.56 
 
 		 329 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  30.56 
 
 		 329 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  30.56 
 
 		 329 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  30.56 
 
 		 329 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  31.47 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  30.56 
 
 		 329 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  30.56 
 
 		 329 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0951  hypothetical protein  29.35 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  30 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  25.74 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  25.74 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  31.33 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  25.32 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  25.32 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  25.32 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  26.73 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0075  fatty acid hydroxylase  25.11 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  30.19 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4648  sterol desaturase-like protein  30.82 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  32.9 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  28.87 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  27.54 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  26.63 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  28.47 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  27.87 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  27.04 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  31.76 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  29.17 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3135  sterol desaturase-like  25.21 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  25.35 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  23.68 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  27.27 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  27.89 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  28.1 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  30.25 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4807  fatty acid hydroxylase  34.59 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  27.89 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  29.09 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  27.83 
 
 		 431 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  27.89 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2751  hypothetical protein  30.94 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  25.76 
 
 		 626 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>