236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2554 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
283 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  50.55 
 
 
289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  47.99 
 
 
289 aa  252  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  43.55 
 
 
274 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  39.44 
 
 
272 aa  158  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  34.02 
 
 
273 aa  151  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  34.41 
 
 
283 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  33.07 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  39.9 
 
 
279 aa  145  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  31.54 
 
 
304 aa  145  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  35.12 
 
 
264 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  35.02 
 
 
267 aa  143  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  35.66 
 
 
330 aa  142  9e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  35.66 
 
 
330 aa  142  9e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  37.85 
 
 
292 aa  139  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  34.14 
 
 
270 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  33.66 
 
 
278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  34.26 
 
 
256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  32.24 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  35 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  32.8 
 
 
256 aa  133  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  34.17 
 
 
270 aa  132  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  35.08 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  36.27 
 
 
270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  35.34 
 
 
257 aa  128  9.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  32.52 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  28.74 
 
 
267 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  32.05 
 
 
264 aa  124  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  32.26 
 
 
272 aa  123  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  30.04 
 
 
264 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  30.92 
 
 
258 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  32.86 
 
 
282 aa  119  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  35.71 
 
 
274 aa  117  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  37.71 
 
 
265 aa  116  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  30.33 
 
 
273 aa  115  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  34.74 
 
 
259 aa  115  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 
268 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  28.74 
 
 
288 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  34.55 
 
 
278 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  33.94 
 
 
276 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  36.51 
 
 
337 aa  99.8  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  26.59 
 
 
380 aa  82.4  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  28.23 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  27.59 
 
 
386 aa  76.3  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  29.07 
 
 
401 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  29.07 
 
 
401 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  31.74 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  31.34 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  27.84 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  29.78 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  28.17 
 
 
374 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  24.8 
 
 
376 aa  72.8  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  24.77 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  24.25 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  23.86 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  30.56 
 
 
386 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  24.89 
 
 
407 aa  68.9  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  27.41 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  30.67 
 
 
431 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3145  hypothetical protein  28.57 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.168968  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  27.68 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  33.79 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0281  fatty acid hydroxylase  29.03 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  29.37 
 
 
374 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  29.37 
 
 
373 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  29.37 
 
 
373 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6122  fatty acid hydroxylase  27.45 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  29.37 
 
 
301 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  29.27 
 
 
402 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  27.72 
 
 
322 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1221  fatty acid hydroxylase  28.27 
 
 
301 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.387146  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  28.29 
 
 
285 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  26.45 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  29.75 
 
 
288 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  29.75 
 
 
288 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  28.38 
 
 
407 aa  63.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  29.75 
 
 
288 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  29.75 
 
 
288 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  30.63 
 
 
314 aa  63.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1130  fatty acid hydroxylase  28.27 
 
 
301 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  30.87 
 
 
431 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  28.85 
 
 
271 aa  63.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  31.45 
 
 
308 aa  62.4  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  27.42 
 
 
328 aa  62.4  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  26.56 
 
 
315 aa  62.4  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  29.88 
 
 
218 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  29.88 
 
 
218 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  30.2 
 
 
431 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  27.2 
 
 
282 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  28.8 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  28.84 
 
 
374 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  29.48 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  29.51 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  30.2 
 
 
431 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2332  hypothetical protein  26.54 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  30.48 
 
 
377 aa  60.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  29.48 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  29.48 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3860  hypothetical protein  23.48 
 
 
314 aa  60.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0371  putative transmembrane fatty acid synthesis protein  30.16 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  0.675671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>