234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4158 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  100 
 
 		 336 aa  683    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  32.87 
 
 		 325 aa  142  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0689  sterol desaturase-like protein  27.78 
 
 		 284 aa  106  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  31.94 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  27.46 
 
 		 274 aa  89.7  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  30.86 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  32.8 
 
 		 284 aa  86.3  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  29.31 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  26.48 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  29.19 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  30.35 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  30.56 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  29.57 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  24.64 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  30 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  28.24 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  29.49 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  27.22 
 
 		 265 aa  79  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  30.53 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  30.68 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  26.13 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  31.58 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  27.23 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  27.55 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  27.33 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  24.86 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  30.91 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  27.84 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  27.72 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  26.06 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  26.06 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  26.11 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  25 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  30.36 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  32.65 
 
 		 373 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  29.02 
 
 		 276 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  32.65 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  29.38 
 
 		 282 aa  72  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  32.65 
 
 		 373 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  29.09 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  28.41 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  32.65 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  27.47 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55230  hypothetical protein  31.58 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.226286  hitchhiker  0.000000221588 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  22.8 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  24.22 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  24.22 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  28.74 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  24.22 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  29.73 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  26.67 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  31.08 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4808  hypothetical protein  29.82 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0507867  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  29.17 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  24.48 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  24.2 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5467  hypothetical protein  27.27 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189673  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  30.3 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4845  fatty acid hydroxylase  28.32 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  29.59 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  27.27 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4274  hypothetical protein  26.4 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  27.27 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  29.73 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  28.65 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  28.12 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  25.93 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  28.83 
 
 		 431 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  30.48 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  30.2 
 
 		 401 aa  67  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  30.2 
 
 		 401 aa  67  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  29.53 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  30.67 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  27.01 
 
 		 259 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  27.74 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  26.29 
 
 		 597 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  26.29 
 
 		 597 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  26.18 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2304  fatty acid hydroxylase  31.21 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  30.11 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  25.94 
 
 		 626 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  25.89 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  28.39 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  28.39 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  28.1 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  29.03 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1096  fatty acid hydroxylase  31.13 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.354603  normal  0.159739 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  24.5 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  26.9 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  28.8 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  28.33 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  30.23 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  25.37 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  24.75 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  27.74 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  25.62 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  30.99 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  29.21 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  24.75 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  29.03 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>