266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2963 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  100 
 
 		 270 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  60.54 
 
 		 272 aa  325  4.0000000000000003e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  59.39 
 
 		 272 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  47.19 
 
 		 279 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  50.19 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  48.32 
 
 		 283 aa  241  7e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  47.58 
 
 		 273 aa  236  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  45.91 
 
 		 270 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  46.54 
 
 		 330 aa  229  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  46.54 
 
 		 330 aa  229  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  43.38 
 
 		 267 aa  223  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  42.32 
 
 		 278 aa  221  8e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  44.66 
 
 		 272 aa  219  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  43.28 
 
 		 267 aa  219  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  42.8 
 
 		 256 aa  216  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  41.64 
 
 		 304 aa  215  5e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  42.38 
 
 		 256 aa  215  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  41.48 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  42.53 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  43.1 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  43.87 
 
 		 264 aa  208  9e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  40.53 
 
 		 295 aa  206  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  43.32 
 
 		 287 aa  204  8e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  44.62 
 
 		 259 aa  203  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  41.95 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  42.11 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  43.86 
 
 		 270 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  34.62 
 
 		 289 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  35.35 
 
 		 274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  36.76 
 
 		 283 aa  129  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  36.5 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  34.88 
 
 		 288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  38.89 
 
 		 284 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  36.52 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  33.74 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  33.8 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  33.8 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  30.42 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  32.08 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  29.02 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  30.28 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  36.08 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  35.29 
 
 		 376 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  39.68 
 
 		 337 aa  92.4  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  36.36 
 
 		 374 aa  91.3  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  33.96 
 
 		 275 aa  89.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  28.93 
 
 		 328 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  30.28 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  30.84 
 
 		 295 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  34.73 
 
 		 377 aa  86.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  32.45 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  26.43 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  28.9 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  28.9 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  28.44 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  28.9 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  30.68 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  33.11 
 
 		 380 aa  82  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  30.36 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4845  fatty acid hydroxylase  28.46 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  31.29 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  29.05 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  35 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2751  hypothetical protein  32.44 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  37.59 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  30.53 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  35 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  34.9 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  31.97 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  29.52 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  30.05 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  29.07 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  29.65 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  30.14 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  33.56 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  35.37 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  31.91 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  32.21 
 
 		 401 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  32.21 
 
 		 401 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  31.45 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4807  fatty acid hydroxylase  35.44 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4808  hypothetical protein  31.69 
 
 		 305 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0507867  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  28.27 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  33.56 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  32.88 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  29.35 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  32.88 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  31.68 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  32.59 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  31.03 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  31.03 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  31.03 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  31.03 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  31.03 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  31.03 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  28.51 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  31.64 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  30.82 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  30.82 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  30.82 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>