249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3766 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 330 aa  663    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 330 aa  663    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  63.5 
 
 		 287 aa  335  7e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  59.78 
 
 		 283 aa  321  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  61 
 
 		 270 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  63.75 
 
 		 278 aa  318  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  57.35 
 
 		 292 aa  315  8e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  60.92 
 
 		 267 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  57.59 
 
 		 256 aa  298  9e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  59.38 
 
 		 264 aa  296  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  55.6 
 
 		 256 aa  290  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  51.57 
 
 		 281 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  51.92 
 
 		 272 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  57.08 
 
 		 295 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  51.97 
 
 		 304 aa  269  4e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  53.94 
 
 		 273 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  57.26 
 
 		 282 aa  259  6e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  49.61 
 
 		 267 aa  259  6e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  52.71 
 
 		 268 aa  258  7e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  47.91 
 
 		 273 aa  242  7e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  45.99 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  47.19 
 
 		 272 aa  226  6e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  44.06 
 
 		 279 aa  223  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  46.54 
 
 		 270 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  48.43 
 
 		 270 aa  219  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  41.51 
 
 		 265 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  40.16 
 
 		 259 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  39.02 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  37.06 
 
 		 283 aa  136  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  34.87 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  36.51 
 
 		 274 aa  131  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  30.71 
 
 		 289 aa  129  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  32.34 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  30.86 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  31.66 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  41.82 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  33.94 
 
 		 291 aa  116  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  35.8 
 
 		 264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  34.57 
 
 		 276 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  34.55 
 
 		 258 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  41.67 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  33.48 
 
 		 337 aa  96.7  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  31.22 
 
 		 376 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  31.9 
 
 		 374 aa  93.2  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  35.37 
 
 		 321 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  37.32 
 
 		 401 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  37.32 
 
 		 401 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  37.32 
 
 		 385 aa  90.5  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  27.91 
 
 		 376 aa  87  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  30.34 
 
 		 373 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  30.34 
 
 		 374 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  30.34 
 
 		 373 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  30.34 
 
 		 301 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  29.18 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  32 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  29.87 
 
 		 431 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  29.44 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  27.31 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  29.87 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  27.27 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  27.96 
 
 		 407 aa  75.9  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  29.03 
 
 		 312 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  28.7 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  29 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  29 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  27.72 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  31.72 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  28.9 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  26.06 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  28.62 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  30.64 
 
 		 626 aa  73.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  32.62 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  28.05 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  32.69 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  29.45 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  29 
 
 		 430 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  26.92 
 
 		 275 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11844  membrane-bound C-5 sterol desaturase erg3 (sterol-c5-desaturase)  27.31 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  31.91 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3418  sterol desaturase-related protein  29.72 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0225552  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  26.59 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0281  fatty acid hydroxylase  28.75 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4434  fatty acid hydroxylase  25.53 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00391015  normal  0.0114256 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  32.65 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  24.14 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  33.81 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3171  sterol desaturase-related protein  32.92 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.0471796 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  29.02 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4845  fatty acid hydroxylase  26.62 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5467  hypothetical protein  28.76 
 
 		 411 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189673  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  30.43 
 
 		 597 aa  69.3  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2332  hypothetical protein  30.95 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  27.82 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  30.43 
 
 		 597 aa  69.3  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  27.82 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  30.06 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  26.3 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  32.91 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4555  hypothetical protein  27.54 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>