285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0500 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  69.58 
 
 
626 aa  759    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  97.65 
 
 
597 aa  1121    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  100 
 
 
597 aa  1191    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  49.15 
 
 
431 aa  346  8e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  52.1 
 
 
430 aa  344  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5467  hypothetical protein  48.59 
 
 
411 aa  340  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189673  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  48.31 
 
 
431 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  48.02 
 
 
431 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  47.46 
 
 
431 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4274  hypothetical protein  46.73 
 
 
412 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  35.42 
 
 
426 aa  217  5e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  39.48 
 
 
400 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  39.34 
 
 
400 aa  205  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0817  YhhN-like  55.76 
 
 
236 aa  203  6e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  40.14 
 
 
319 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  37.45 
 
 
320 aa  193  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2332  hypothetical protein  39.34 
 
 
304 aa  189  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0321  fatty acid hydroxylase  39.06 
 
 
289 aa  188  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  38.75 
 
 
321 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11844  membrane-bound C-5 sterol desaturase erg3 (sterol-c5-desaturase)  39.25 
 
 
314 aa  187  6e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  37.36 
 
 
305 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  37.36 
 
 
305 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  37.36 
 
 
305 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  37.14 
 
 
304 aa  183  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1631  hypothetical protein  38.69 
 
 
312 aa  183  7e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.305969 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3418  sterol desaturase-related protein  39 
 
 
306 aa  183  8.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0225552  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  38.38 
 
 
304 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  37.68 
 
 
304 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  37 
 
 
303 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  37.32 
 
 
304 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  38.38 
 
 
304 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  37.32 
 
 
304 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3171  sterol desaturase-related protein  39.79 
 
 
305 aa  182  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.0471796 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  34.66 
 
 
274 aa  181  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  38.03 
 
 
304 aa  179  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3145  hypothetical protein  41.22 
 
 
297 aa  175  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.168968  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  36.78 
 
 
386 aa  172  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  34.51 
 
 
315 aa  170  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  37.81 
 
 
339 aa  170  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  38.84 
 
 
287 aa  168  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  35.91 
 
 
408 aa  168  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  39.26 
 
 
270 aa  167  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1096  fatty acid hydroxylase  34.8 
 
 
310 aa  167  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.354603  normal  0.159739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2901  fatty acid hydroxylase  39.02 
 
 
326 aa  167  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800123  normal  0.025383 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  34.4 
 
 
407 aa  167  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  43.62 
 
 
218 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  43.62 
 
 
218 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  37.6 
 
 
287 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  38.84 
 
 
288 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  40.5 
 
 
288 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  30.67 
 
 
407 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2864  sterol desaturase-related protein  37.29 
 
 
312 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  38.02 
 
 
287 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  40.5 
 
 
288 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2908  sterol desaturase-related protein  37.29 
 
 
312 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887939  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2894  sterol desaturase-related protein  36.95 
 
 
312 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  40.08 
 
 
288 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  38.02 
 
 
304 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  36.86 
 
 
285 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1074  fatty acid hydroxylase  36.6 
 
 
399 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  35.94 
 
 
287 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  37.6 
 
 
287 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1221  hypothetical protein  33.21 
 
 
275 aa  162  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31242  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5174  fatty acid hydroxylase  37.59 
 
 
291 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  36.96 
 
 
322 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  36.78 
 
 
292 aa  162  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  44.09 
 
 
305 aa  161  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  38.89 
 
 
287 aa  161  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  40 
 
 
314 aa  160  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  31.2 
 
 
402 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  37.13 
 
 
315 aa  159  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  32.73 
 
 
328 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  38.84 
 
 
271 aa  158  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4845  fatty acid hydroxylase  36.55 
 
 
323 aa  157  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6122  fatty acid hydroxylase  40 
 
 
290 aa  157  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  40.4 
 
 
302 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0281  fatty acid hydroxylase  43.94 
 
 
314 aa  157  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1294  fatty acid hydroxylase  34.43 
 
 
298 aa  157  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.443981 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3780  fatty acid hydroxylase  35.04 
 
 
310 aa  154  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  41.4 
 
 
307 aa  152  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3695  fatty acid hydroxylase  36.75 
 
 
298 aa  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00011612  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3860  hypothetical protein  40.61 
 
 
314 aa  151  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06935  hypothetical protein  33.22 
 
 
316 aa  149  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46520  hypothetical protein  41.59 
 
 
282 aa  148  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374857  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  38.74 
 
 
297 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3177  fatty acid hydroxylase  41.12 
 
 
309 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1130  fatty acid hydroxylase  33.22 
 
 
301 aa  144  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  33.47 
 
 
374 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3502  fatty acid hydroxylase  37.17 
 
 
309 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0956724 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3822  hypothetical protein  39.79 
 
 
284 aa  141  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  34.43 
 
 
374 aa  140  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1221  fatty acid hydroxylase  33.44 
 
 
301 aa  140  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.387146  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0469  sterol desaturase-related protein  29.51 
 
 
343 aa  140  8.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.93302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3610  fatty acid hydroxylase  41.12 
 
 
317 aa  139  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  38.8 
 
 
377 aa  138  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0371  putative transmembrane fatty acid synthesis protein  40.62 
 
 
279 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1129  YhhN family protein  48.12 
 
 
221 aa  99.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6146  fatty acid hydroxylase  31.34 
 
 
337 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0995  hypothetical protein  39.26 
 
 
239 aa  92.4  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  31.33 
 
 
281 aa  89  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>