243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0287 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  100 
 
 		 287 aa  568  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  64.44 
 
 		 292 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  63.5 
 
 		 330 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  63.5 
 
 		 330 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  67.16 
 
 		 267 aa  347  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  62.18 
 
 		 283 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  58.97 
 
 		 278 aa  316  4e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  60.98 
 
 		 270 aa  315  6e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  57.79 
 
 		 256 aa  308  5e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  57.92 
 
 		 256 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  58.37 
 
 		 264 aa  276  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  52.55 
 
 		 272 aa  270  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  53.25 
 
 		 295 aa  269  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  49.03 
 
 		 281 aa  261  6e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  52.14 
 
 		 282 aa  258  9e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  53.28 
 
 		 273 aa  257  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  49.22 
 
 		 304 aa  251  7e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  49.62 
 
 		 273 aa  251  8.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  46.54 
 
 		 267 aa  244  9e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  47.49 
 
 		 268 aa  234  8e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  51.77 
 
 		 270 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  41.43 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  43.3 
 
 		 272 aa  218  1e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  44.87 
 
 		 270 aa  215  9e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  42.75 
 
 		 272 aa  208  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  42.91 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  39.25 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  33.72 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  35.71 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  34.82 
 
 		 289 aa  132  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  32.21 
 
 		 274 aa  132  6.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  30.08 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  32.54 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  35.53 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  31.44 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  34.68 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  36.42 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  31.28 
 
 		 258 aa  116  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  32.08 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  36.48 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  37.56 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  30.09 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  31.6 
 
 		 293 aa  92.8  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  33.11 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  30.29 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  36.88 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  27.31 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  28.24 
 
 		 401 aa  82  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  28.24 
 
 		 401 aa  82  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  28.99 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  30.88 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4434  fatty acid hydroxylase  28.86 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00391015  normal  0.0114256 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  31.25 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  27.6 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  26.5 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4807  fatty acid hydroxylase  33.05 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  27.41 
 
 		 275 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  26.51 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  28.64 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  26.51 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  26.6 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  26.6 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5395  fatty acid hydroxylase  30.39 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  31.06 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  27.49 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2374  fatty acid hydroxylase  33.65 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00297557  normal  0.604187 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  30.82 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  32.58 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4808  hypothetical protein  30.39 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0507867  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  26.38 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  28.8 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55230  hypothetical protein  31.07 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.226286  hitchhiker  0.000000221588 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5741  hypothetical protein  26.92 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  29.41 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  32.22 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  28.49 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5320  hypothetical protein  28.02 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.573782 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5691  hypothetical protein  28.02 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.460531 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  29.44 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2296  fatty acid hydroxylase  34.81 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152596 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  30 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  30 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  30 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  30 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  26.49 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  31.03 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39990  hypothetical protein  29.21 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3683  hypothetical protein  27.78 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  30 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  30 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  30 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  32.17 
 
 		 431 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0075  fatty acid hydroxylase  30.41 
 
 		 324 aa  67  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145627 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  29.17 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  28.69 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3388  hypothetical protein  29.21 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0628245  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  30.32 
 
 		 321 aa  67  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  28.5 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1433  hypothetical protein  29.76 
 
 		 324 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>