221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2374 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2374  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
296 aa  583  1e-166  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00297557  normal  0.604187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4808  hypothetical protein  64.33 
 
 
305 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0507867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55230  hypothetical protein  64.19 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.226286  hitchhiker  0.000000221588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4555  hypothetical protein  56.09 
 
 
318 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5741  hypothetical protein  54.78 
 
 
320 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4434  fatty acid hydroxylase  53.71 
 
 
303 aa  279  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00391015  normal  0.0114256 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3298  fatty acid hydroxylase  59.45 
 
 
293 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  54.48 
 
 
284 aa  277  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5286  hypothetical protein  54.24 
 
 
323 aa  273  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.789525  normal  0.137555 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5722  hypothetical protein  54.24 
 
 
323 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  52.51 
 
 
305 aa  271  7e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2304  fatty acid hydroxylase  57.19 
 
 
298 aa  271  9e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5395  fatty acid hydroxylase  55.35 
 
 
295 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3683  hypothetical protein  55.56 
 
 
322 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5320  hypothetical protein  54.96 
 
 
322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.573782 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5691  hypothetical protein  54.96 
 
 
322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.460531 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1433  hypothetical protein  54.55 
 
 
324 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1451  hypothetical protein  54.55 
 
 
324 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  54.03 
 
 
269 aa  263  3e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  40.41 
 
 
413 aa  186  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  39 
 
 
400 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  33.2 
 
 
282 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  29.93 
 
 
328 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  31.16 
 
 
291 aa  88.2  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  32.99 
 
 
293 aa  84  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  28.86 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  32.02 
 
 
385 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  29.82 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  32.39 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  32.39 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  30.24 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  29.03 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  32.42 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  29.19 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  27.27 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  28.5 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  31.25 
 
 
267 aa  75.5  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  29.38 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  30 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  30.39 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  29.83 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  34.05 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  29.61 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  34.91 
 
 
287 aa  72  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  26.02 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  27.53 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  29.12 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  29.29 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  28.42 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  26.47 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  28.42 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  35.8 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  28.42 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  29.65 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  27.5 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  28.22 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  32.97 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  29.9 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  34.39 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  29.55 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  29.9 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  29.9 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  26.34 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  31.18 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  28.87 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  31.18 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  29.17 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  29.78 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  29.88 
 
 
321 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  31.14 
 
 
265 aa  67  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  29.9 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  29.41 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  25.53 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  30.6 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  30.6 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  32.57 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  30.32 
 
 
304 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  30.32 
 
 
304 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  29.68 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  34.1 
 
 
324 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  31.21 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  29.41 
 
 
304 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  29.27 
 
 
284 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  29.05 
 
 
270 aa  63.5  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  27.81 
 
 
337 aa  62.8  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3418  sterol desaturase-related protein  29.05 
 
 
306 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0225552  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  29.27 
 
 
287 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  27.96 
 
 
256 aa  62.4  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  32.59 
 
 
285 aa  62.4  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  30.13 
 
 
287 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  28.33 
 
 
257 aa  62  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  31.35 
 
 
264 aa  62  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  30.13 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  29.14 
 
 
320 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  30.13 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  27.32 
 
 
278 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  32.59 
 
 
314 aa  60.8  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0371  putative transmembrane fatty acid synthesis protein  33.03 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  30.67 
 
 
332 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3171  sterol desaturase-related protein  30.11 
 
 
305 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.0471796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>