233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1644 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 295 aa  585  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  46.84 
 
 		 275 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  33.21 
 
 		 374 aa  136  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  38.2 
 
 		 380 aa  132  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  37.91 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  37.22 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  31.66 
 
 		 385 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  32.42 
 
 		 373 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  32.42 
 
 		 374 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  36.98 
 
 		 386 aa  122  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  32.42 
 
 		 301 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  32.03 
 
 		 373 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  38.73 
 
 		 401 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  38.73 
 
 		 401 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  35.48 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  32.39 
 
 		 291 aa  109  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  37.36 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 		 413 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  35.39 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  31.25 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  34.46 
 
 		 400 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  32.23 
 
 		 270 aa  97.4  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  32.09 
 
 		 276 aa  94  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  30.56 
 
 		 321 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  37.71 
 
 		 331 aa  92.8  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  34.97 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  30.7 
 
 		 283 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  37.74 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  39.86 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  35.1 
 
 		 273 aa  89  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  30.85 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  39.16 
 
 		 324 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  34.68 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  35.26 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  29.79 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  39.16 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1629  fatty acid hydroxylase  33.15 
 
 		 324 aa  87  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0812703  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  32.44 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  29.94 
 
 		 256 aa  87.4  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55230  hypothetical protein  30.8 
 
 		 301 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.226286  hitchhiker  0.000000221588 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  28.88 
 
 		 269 aa  85.9  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4808  hypothetical protein  30.48 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0507867  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  31.84 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  30.36 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  31.6 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  32.43 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  28.47 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  28.92 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  28.51 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  28.98 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  28.51 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  28.51 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2304  fatty acid hydroxylase  35.62 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  27.74 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  35.29 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  30.6 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  27.76 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2079  hypothetical protein  36.63 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.768511  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  31.76 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  36.42 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2062  transmembrane protein  37.24 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  28.16 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  30.51 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  28.16 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  28.16 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  28.16 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  28.16 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  28.16 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  32.57 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  31.65 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  27.9 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  27.67 
 
 		 329 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  31.17 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  30.14 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4434  fatty acid hydroxylase  31.28 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00391015  normal  0.0114256 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1186  hypothetical protein  33.89 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.502028 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  27.69 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  27.69 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  31.18 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  31.36 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0075  fatty acid hydroxylase  30.04 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145627 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5741  hypothetical protein  30.9 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1106  fatty acid hydroxylase  32.96 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  34.01 
 
 		 327 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  28.88 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5722  hypothetical protein  29.78 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5286  hypothetical protein  29.78 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.789525  normal  0.137555 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  31.33 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1433  hypothetical protein  29.7 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3135  sterol desaturase-like  27.88 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  31.28 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1451  hypothetical protein  29.7 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  32.1 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  30.3 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  27.97 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  34.67 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  30.22 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  32.58 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4555  hypothetical protein  31.43 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  28.65 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>