249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2296 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 292 aa  587  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  64.44 
 
 		 287 aa  362  5.0000000000000005e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  56.68 
 
 		 283 aa  326  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  57.35 
 
 		 330 aa  324  8.000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  57.35 
 
 		 330 aa  324  8.000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  56.39 
 
 		 270 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  57.4 
 
 		 278 aa  303  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  57.14 
 
 		 256 aa  300  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  54.75 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  57.31 
 
 		 267 aa  295  6e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  50.39 
 
 		 273 aa  266  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  51.45 
 
 		 282 aa  262  4.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  49.01 
 
 		 281 aa  261  6.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  50.97 
 
 		 304 aa  255  7e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  45.39 
 
 		 295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  51.94 
 
 		 264 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  42.16 
 
 		 279 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  46.51 
 
 		 272 aa  242  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  44.66 
 
 		 273 aa  235  8e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  43.56 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  45.21 
 
 		 268 aa  226  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  48.3 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  43.04 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  38.55 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  38.6 
 
 		 272 aa  202  5e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  38.26 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  37.15 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  37.85 
 
 		 283 aa  142  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  30.8 
 
 		 284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 		 289 aa  133  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  33.67 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  35.12 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  37.76 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  36.04 
 
 		 288 aa  125  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  37.79 
 
 		 264 aa  125  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  32.9 
 
 		 258 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  35.44 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  38.96 
 
 		 274 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  33.7 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  30.3 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  26.27 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  36.28 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 		 321 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  32.64 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  33.1 
 
 		 376 aa  82.4  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  29.08 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  32.7 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  28.66 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  31.25 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  27.93 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  27.03 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  26.53 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  31.16 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  31.16 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  31.45 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4808  hypothetical protein  29.06 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0507867  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  31.06 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55230  hypothetical protein  29.06 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.226286  hitchhiker  0.000000221588 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  31.13 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  31.13 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  31.13 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  29.33 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  29.89 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  27.69 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  31.25 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5741  hypothetical protein  26.19 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5320  hypothetical protein  29.51 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.573782 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  29.87 
 
 		 282 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4434  fatty acid hydroxylase  31.08 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00391015  normal  0.0114256 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5691  hypothetical protein  29.51 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.460531 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4555  hypothetical protein  27.23 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  31.55 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3683  hypothetical protein  27.01 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2374  fatty acid hydroxylase  33.12 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00297557  normal  0.604187 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39990  hypothetical protein  31.65 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  28.66 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  32.43 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3388  hypothetical protein  31.08 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0628245  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  32.37 
 
 		 626 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  31.36 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11844  membrane-bound C-5 sterol desaturase erg3 (sterol-c5-desaturase)  27.1 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  30.99 
 
 		 597 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  29.63 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  29.65 
 
 		 295 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  30.41 
 
 		 597 aa  67  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  33.14 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  28.22 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  32.26 
 
 		 431 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  24.63 
 
 		 386 aa  65.9  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  28.57 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  26.19 
 
 		 336 aa  65.5  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  26.24 
 
 		 430 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5286  hypothetical protein  25.73 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.789525  normal  0.137555 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  26.01 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5722  hypothetical protein  25.73 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3695  fatty acid hydroxylase  30.26 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00011612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  22.91 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  31.88 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  28.92 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5395  fatty acid hydroxylase  26.97 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.291326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>