214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1331 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 276 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  37.43 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  32.05 
 
 		 380 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  30.87 
 
 		 273 aa  95.9  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  32.34 
 
 		 281 aa  95.9  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  30.49 
 
 		 386 aa  93.2  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  35.26 
 
 		 267 aa  88.6  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  32.09 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  32.81 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  30 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  32.19 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  30 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  31.52 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  29.12 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  30.05 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  27.14 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  28.49 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  31.16 
 
 		 374 aa  79  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  29.41 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  31.82 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  31.82 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  31.82 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  30.67 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  31.82 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  28.44 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  28.67 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46520  hypothetical protein  35.71 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374857  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  28.43 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1074  fatty acid hydroxylase  31.54 
 
 		 399 aa  76.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  30.34 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  30.14 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  26.32 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  32.88 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  34.33 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  25.63 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  30.56 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  33.09 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  29 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  32.65 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  32.6 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  27.56 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  30.56 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  31.85 
 
 		 282 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  32.33 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  28 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  28.42 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  30.18 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  26.87 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0371  putative transmembrane fatty acid synthesis protein  30.99 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  28.33 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  30.38 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  25.39 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  33.14 
 
 		 400 aa  69.3  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  24.32 
 
 		 407 aa  68.9  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  27.92 
 
 		 402 aa  68.9  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3610  fatty acid hydroxylase  32.87 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  30.5 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  28.73 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  32.37 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3135  sterol desaturase-like  29.85 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1631  hypothetical protein  33.33 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.305969 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  30.67 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  26.85 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  29.49 
 
 		 431 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3780  fatty acid hydroxylase  32.82 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  31.25 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  28.77 
 
 		 626 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  31.25 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  27.78 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  28.66 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  28.66 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  25.71 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  28.66 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  32.81 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  31.01 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1221  hypothetical protein  31.34 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31242  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5174  fatty acid hydroxylase  30.3 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  33.1 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  28.02 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  23.45 
 
 		 430 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  30.83 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  25.71 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  27.78 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  31.43 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  28.65 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  28.85 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  31.06 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  29.75 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  30.07 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3177  fatty acid hydroxylase  31.25 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  31.43 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3502  fatty acid hydroxylase  31.25 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0956724 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  30.08 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  27.37 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  33.59 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  28.09 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  32.87 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  30.28 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>