250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1012 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  673    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  42.77 
 
 		 264 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  34.43 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  35.53 
 
 		 257 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  33.73 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  37.95 
 
 		 264 aa  126  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  38.55 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  34.92 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  37.82 
 
 		 258 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  38.85 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  42.76 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  33.58 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  36.72 
 
 		 265 aa  116  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  39.74 
 
 		 267 aa  116  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  34.78 
 
 		 273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  39.35 
 
 		 270 aa  115  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  33.48 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  35.11 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  33.48 
 
 		 330 aa  112  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  32.05 
 
 		 279 aa  112  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  33.48 
 
 		 330 aa  112  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  31.08 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  36.62 
 
 		 283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  34.8 
 
 		 267 aa  109  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  38.5 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  37.58 
 
 		 272 aa  107  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  39.74 
 
 		 270 aa  105  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  39.89 
 
 		 282 aa  105  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  34.73 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  33.68 
 
 		 270 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  33.18 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  31.11 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  36.28 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  37.82 
 
 		 288 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  38.51 
 
 		 272 aa  102  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  35.51 
 
 		 264 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  31.8 
 
 		 256 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  32.08 
 
 		 374 aa  97.8  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  30.51 
 
 		 385 aa  96.3  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  31.58 
 
 		 401 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  35.77 
 
 		 268 aa  95.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  31.58 
 
 		 401 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  32.56 
 
 		 291 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  32.79 
 
 		 413 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  29.55 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  29.67 
 
 		 315 aa  89  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  33.55 
 
 		 274 aa  87.4  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  29.15 
 
 		 274 aa  86.7  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  31.58 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  27.87 
 
 		 293 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  31.28 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  34.81 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  31.17 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  35.58 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  30.91 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  32.28 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  28.71 
 
 		 291 aa  82.4  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  30.81 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  29.91 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3860  hypothetical protein  30.17 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  29.43 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  31.87 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  31.61 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  31.51 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1221  fatty acid hydroxylase  30.77 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.387146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  31.87 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  31.87 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  31.87 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  31.87 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  31.87 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  31.87 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  34.16 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  27.8 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  35.57 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  31.47 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1130  fatty acid hydroxylase  30.51 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1631  hypothetical protein  31.03 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.305969 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  34.84 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  30.39 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  29.32 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  34.18 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  29.61 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  29.19 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  33.74 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  29.19 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  29.19 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3695  fatty acid hydroxylase  28.39 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00011612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  30.93 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  30.46 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  30.46 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  32.52 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  34.16 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  33.33 
 
 		 407 aa  76.3  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  32.52 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  32.52 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  32.52 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  33.12 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  35.44 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  33.11 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  35.44 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>