241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3261 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  529  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  68.82 
 
 		 256 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  66.79 
 
 		 256 aa  359  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  59.38 
 
 		 330 aa  312  4.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  59.38 
 
 		 330 aa  312  4.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  58.3 
 
 		 267 aa  293  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  58.4 
 
 		 278 aa  290  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  55.25 
 
 		 270 aa  285  5e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  51.15 
 
 		 281 aa  285  5.999999999999999e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  55.73 
 
 		 272 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  56.27 
 
 		 283 aa  280  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  53.15 
 
 		 304 aa  277  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  54.65 
 
 		 273 aa  276  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  58.37 
 
 		 287 aa  275  7e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  51.94 
 
 		 292 aa  259  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  50.58 
 
 		 295 aa  259  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  47.27 
 
 		 267 aa  242  3.9999999999999997e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  50.58 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  47.35 
 
 		 268 aa  231  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  45.25 
 
 		 272 aa  229  3e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  45.38 
 
 		 273 aa  223  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  44.15 
 
 		 272 aa  218  6e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  43.87 
 
 		 270 aa  218  7e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  43.85 
 
 		 279 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  48.25 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  40.07 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  41.5 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  35.34 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  36.14 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  34.78 
 
 		 284 aa  135  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  35.12 
 
 		 283 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  37 
 
 		 274 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  31.54 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  36.76 
 
 		 288 aa  125  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  36.7 
 
 		 264 aa  123  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  29.76 
 
 		 274 aa  122  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  31.4 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  29.88 
 
 		 264 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  35.93 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  32.11 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  28.46 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  34.27 
 
 		 337 aa  89.7  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  30.89 
 
 		 376 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  32.89 
 
 		 321 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  30.21 
 
 		 376 aa  85.5  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  34.97 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  28.57 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  27.43 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  32.07 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  27.43 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  28.66 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  32.37 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  30.32 
 
 		 328 aa  75.5  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  33.66 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  27.89 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  34.44 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  29.59 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  27.14 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  27.14 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  27.14 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  27.14 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  34.01 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  31.21 
 
 		 380 aa  72  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  34.67 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  29.17 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  26.87 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  33.1 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  24.28 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  33.1 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2751  hypothetical protein  27.37 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  28.52 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39990  hypothetical protein  29.85 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  29.41 
 
 		 386 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3388  hypothetical protein  29.85 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0628245  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  30.26 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  34.93 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  28.03 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  28.03 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  28.03 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  28.03 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  32.91 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  28.03 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  28.03 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  30.39 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  27.83 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  28.12 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  26.45 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1903  hypothetical protein  31.43 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  25 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  30.29 
 
 		 626 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  25.89 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  26.97 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  27.14 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  29.8 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4807  fatty acid hydroxylase  31.31 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  29.39 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  30.15 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3695  fatty acid hydroxylase  30.91 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00011612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  24.65 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>