249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1140 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  625  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  62.5 
 
 		 281 aa  330  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  62.81 
 
 		 273 aa  305  5.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  54.89 
 
 		 267 aa  302  4.0000000000000003e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  51.97 
 
 		 330 aa  269  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  51.97 
 
 		 330 aa  269  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  53.15 
 
 		 264 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  51.34 
 
 		 256 aa  260  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  54.12 
 
 		 273 aa  257  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  51.35 
 
 		 256 aa  256  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  50.63 
 
 		 295 aa  252  7e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  50.98 
 
 		 270 aa  247  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  48.64 
 
 		 272 aa  247  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  50.76 
 
 		 278 aa  246  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  48.83 
 
 		 267 aa  245  4.9999999999999997e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  52.94 
 
 		 283 aa  245  8e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  50.97 
 
 		 292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  49.22 
 
 		 287 aa  233  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  50.19 
 
 		 282 aa  225  9e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  44.31 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  48.32 
 
 		 270 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  43.75 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  46.06 
 
 		 259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  44.71 
 
 		 268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  41.64 
 
 		 270 aa  206  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  42.97 
 
 		 272 aa  202  5e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  36.84 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  37.31 
 
 		 274 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  32.41 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  34.34 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  32.27 
 
 		 289 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  31.2 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  28.24 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  31.05 
 
 		 264 aa  122  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  32.13 
 
 		 264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  29.92 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  34.62 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  33.64 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  28.9 
 
 		 278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  33.69 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  30.53 
 
 		 291 aa  99  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  33.18 
 
 		 337 aa  98.6  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  32.31 
 
 		 376 aa  92.4  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  32.42 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  27.97 
 
 		 380 aa  90.1  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  30.64 
 
 		 374 aa  90.1  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  31.25 
 
 		 281 aa  89  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  28.15 
 
 		 386 aa  86.7  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  30.3 
 
 		 413 aa  82.8  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  30.26 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  30.26 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  30.05 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  29.61 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  29.49 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  34.01 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  29.49 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  29.49 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  29.49 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  27.37 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  32.88 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  32.88 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  32.88 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  32.88 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  32.88 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  32.88 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  31.29 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  34.04 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  27.57 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  30.91 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39990  hypothetical protein  35.81 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3388  hypothetical protein  35.81 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0628245  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  31.97 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  30.99 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  31.52 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  32.21 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  31.88 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  31.21 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  27.35 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  30.87 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  28.81 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  30.67 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  31.29 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  31.29 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  31.29 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4807  fatty acid hydroxylase  33.75 
 
 		 249 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  28.48 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  27.21 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1629  fatty acid hydroxylase  30 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0812703  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  29.08 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  28.14 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  29.03 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  26.6 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  30.87 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  30.87 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  34.46 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  28.14 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  31.01 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  32.64 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  30 
 
 		 597 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  28.29 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>