221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4807 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4807  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
249 aa  503  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0951  hypothetical protein  41.42 
 
 
244 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2751  hypothetical protein  37.97 
 
 
240 aa  178  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3388  hypothetical protein  39.65 
 
 
255 aa  178  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0628245  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39990  hypothetical protein  39.21 
 
 
255 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1903  hypothetical protein  38.91 
 
 
245 aa  165  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  40.72 
 
 
526 aa  126  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  32.68 
 
 
321 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  33.7 
 
 
272 aa  78.6  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  31.19 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  35.44 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  28.37 
 
 
279 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  32.69 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  32.7 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  30.43 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  33.77 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  27.6 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  30.68 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  28.42 
 
 
281 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  30.41 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  34.9 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  32.14 
 
 
330 aa  67  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  33.33 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  32.14 
 
 
330 aa  67  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  29.8 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  29.19 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  31.21 
 
 
271 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  32.64 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  31.29 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  30.92 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  30.92 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  28.4 
 
 
315 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  30.92 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  32.2 
 
 
273 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  30.05 
 
 
264 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  33.78 
 
 
287 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  32.3 
 
 
314 aa  63.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  32.24 
 
 
282 aa  63.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  35.86 
 
 
337 aa  62  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  30.19 
 
 
413 aa  62  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  34.97 
 
 
304 aa  62  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  31.93 
 
 
274 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  30.86 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  33.12 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  31.21 
 
 
322 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  34.87 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  34.87 
 
 
287 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  31.91 
 
 
285 aa  60.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  33.12 
 
 
304 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  33.12 
 
 
304 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  34.59 
 
 
289 aa  60.1  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  27.61 
 
 
386 aa  60.1  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1631  hypothetical protein  28.18 
 
 
312 aa  59.7  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.305969 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  32.53 
 
 
321 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  30.11 
 
 
302 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  26.34 
 
 
284 aa  59.3  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  35.07 
 
 
289 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  31.03 
 
 
264 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  28.49 
 
 
407 aa  59.3  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  32.5 
 
 
304 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  28.12 
 
 
292 aa  58.9  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  33.33 
 
 
292 aa  58.9  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  31.47 
 
 
315 aa  58.9  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  29.45 
 
 
270 aa  58.9  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  29.73 
 
 
270 aa  58.5  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2332  hypothetical protein  27.59 
 
 
304 aa  58.5  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  33.55 
 
 
287 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  36.17 
 
 
328 aa  58.5  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  29.14 
 
 
274 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  27.71 
 
 
324 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  30.92 
 
 
321 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  31.25 
 
 
264 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  33.55 
 
 
288 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  29.63 
 
 
319 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  32.19 
 
 
304 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  32.89 
 
 
287 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  29.8 
 
 
303 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  33.55 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  32.89 
 
 
288 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0689  sterol desaturase-like protein  29.78 
 
 
284 aa  57.4  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  29.19 
 
 
283 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  29.68 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  32.89 
 
 
288 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  30.18 
 
 
320 aa  57  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3780  fatty acid hydroxylase  30 
 
 
310 aa  57  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  30.26 
 
 
320 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  31.94 
 
 
304 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  30.23 
 
 
257 aa  56.6  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1130  fatty acid hydroxylase  31.58 
 
 
301 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  29.14 
 
 
305 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  32.24 
 
 
287 aa  56.6  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  29.14 
 
 
305 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  29.14 
 
 
305 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  30.81 
 
 
431 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  28.72 
 
 
304 aa  56.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3135  sterol desaturase-like  29.07 
 
 
250 aa  55.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3145  hypothetical protein  31.66 
 
 
297 aa  55.8  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.168968  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  30.41 
 
 
304 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  31.89 
 
 
431 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1221  hypothetical protein  28.16 
 
 
275 aa  55.5  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>