232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2079 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2079  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  638    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.768511  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  67.07 
 
 		 328 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  64.42 
 
 		 320 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1629  fatty acid hydroxylase  63.61 
 
 		 324 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0812703  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  61.77 
 
 		 321 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  63.03 
 
 		 326 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1106  fatty acid hydroxylase  67.26 
 
 		 332 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1186  hypothetical protein  66.67 
 
 		 332 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.502028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  62.69 
 
 		 331 aa  381  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  55.05 
 
 		 324 aa  361  9e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  56.44 
 
 		 324 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  54.23 
 
 		 331 aa  348  9e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2062  transmembrane protein  56.48 
 
 		 324 aa  339  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  55.83 
 
 		 324 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  47.84 
 
 		 325 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  48.46 
 
 		 324 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  48.46 
 
 		 324 aa  305  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  49.38 
 
 		 327 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  46.89 
 
 		 332 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  47.22 
 
 		 324 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  47.22 
 
 		 324 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  47.22 
 
 		 324 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  48.08 
 
 		 329 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  46.3 
 
 		 324 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  48.08 
 
 		 329 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  48.08 
 
 		 329 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  48.08 
 
 		 329 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  48.08 
 
 		 329 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  48.08 
 
 		 329 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  47.76 
 
 		 329 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  46.89 
 
 		 332 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  40.2 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  41.56 
 
 		 308 aa  205  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0075  fatty acid hydroxylase  36.83 
 
 		 324 aa  192  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145627 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  36.43 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2296  fatty acid hydroxylase  37.42 
 
 		 374 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152596 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  27.39 
 
 		 291 aa  92.4  9e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  32.97 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  29.65 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  28.62 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  36.63 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  28.83 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  30.18 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  26.69 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  27.49 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  28.31 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  25.47 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  29.07 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  31.48 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  28.41 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  26.55 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  29.9 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  27.61 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2772  putative sterol desaturase  31.4 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.788524  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  26.42 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  28.87 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  27.22 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  27.98 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  29.44 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  29.94 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  30.57 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  25.52 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  29.94 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  26.4 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  31.15 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  27.5 
 
 		 431 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  27.08 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  24.23 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  29.74 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1074  fatty acid hydroxylase  28.48 
 
 		 399 aa  62.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  26.67 
 
 		 408 aa  62.8  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  25.96 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  24.68 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  30.36 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5310  fatty acid hydroxylase  26.23 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000145361  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  24.68 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  24.68 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  25.93 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  29.79 
 
 		 267 aa  62.4  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  28.85 
 
 		 597 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  30.05 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  28.75 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  27.5 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  28.9 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  27.5 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  28.85 
 
 		 597 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  29.56 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  30 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  29.51 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  28.06 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  29.51 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  30.87 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  28.06 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  29.51 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  28.06 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  28.06 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  27.1 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  29.19 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  24.24 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>