228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2062 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2062  transmembrane protein  100 
 
 
324 aa  652    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  84.29 
 
 
331 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  67.92 
 
 
324 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  70.51 
 
 
324 aa  447  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  68.24 
 
 
324 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1629  fatty acid hydroxylase  56.39 
 
 
324 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0812703  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  56.55 
 
 
328 aa  360  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  56.47 
 
 
326 aa  355  5e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  56.69 
 
 
331 aa  347  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  54.4 
 
 
320 aa  346  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2079  hypothetical protein  56.48 
 
 
324 aa  341  1e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.768511  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  51.56 
 
 
321 aa  333  3e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  49.53 
 
 
329 aa  322  4e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1106  fatty acid hydroxylase  56.29 
 
 
332 aa  322  8e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1186  hypothetical protein  56.51 
 
 
332 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.502028 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  49.22 
 
 
329 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  49.22 
 
 
329 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  49.22 
 
 
329 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  47.52 
 
 
325 aa  318  9e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  47.5 
 
 
332 aa  317  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  48.9 
 
 
329 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  48.9 
 
 
329 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  48.9 
 
 
329 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  47.2 
 
 
324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  49.06 
 
 
327 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  46.89 
 
 
324 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  46.89 
 
 
324 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  46.89 
 
 
324 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  46.89 
 
 
324 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  46.89 
 
 
324 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  47.08 
 
 
323 aa  305  5.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  47.81 
 
 
332 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  39.56 
 
 
308 aa  228  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0075  fatty acid hydroxylase  37.81 
 
 
324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145627 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  36.79 
 
 
297 aa  186  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2296  fatty acid hydroxylase  38.27 
 
 
374 aa  182  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  29.55 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  25.93 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  30.07 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  30 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  29.08 
 
 
386 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  27.63 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  31.66 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  37.97 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  31.94 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  30.41 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  29.89 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  27.96 
 
 
374 aa  72.8  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  31.07 
 
 
426 aa  72.8  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  34.15 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  30.81 
 
 
287 aa  72  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46520  hypothetical protein  36.24 
 
 
282 aa  72.4  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374857  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  28.96 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  29.82 
 
 
288 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  29.82 
 
 
314 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  30.21 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  30.27 
 
 
287 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  33.56 
 
 
287 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1096  fatty acid hydroxylase  28.66 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.354603  normal  0.159739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  29.82 
 
 
288 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  28.96 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  28.96 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  26.92 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  31.44 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  25.72 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  31.28 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  33.56 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  29.24 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  28.65 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  35.82 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  25.35 
 
 
385 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  29.96 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  28.96 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  32.04 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  29.24 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  29.03 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  26.91 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  28.82 
 
 
339 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  32.72 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  29.11 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  29.48 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  24.48 
 
 
401 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  24.48 
 
 
401 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  30.04 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1631  hypothetical protein  29.67 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.305969 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  31.76 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  31.34 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  25.27 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  30.49 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  31.97 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  30.77 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  29.5 
 
 
407 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  29.34 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  32.45 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4507  fatty acid hydroxylase  25.11 
 
 
373 aa  65.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  30.61 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  30.85 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  30.85 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  30.85 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  34.81 
 
 
284 aa  65.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>