203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0600 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0600  sterol desaturase-like  100 
 
 		 306 aa  626  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0615  sterol desaturase-like  41.1 
 
 		 331 aa  226  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  32.02 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  28.17 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  29.12 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  25.31 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  26.53 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  29.84 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  26.98 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  31.9 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  28.43 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  28.29 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  30.66 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  29.79 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  29.79 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  30.14 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  26.51 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  28 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3780  fatty acid hydroxylase  31.21 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0371  putative transmembrane fatty acid synthesis protein  32.02 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  28.7 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  29.38 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  29.94 
 
 		 297 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  29.2 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  32.02 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  26.32 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  25.59 
 
 		 400 aa  65.9  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1096  fatty acid hydroxylase  28.39 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.354603  normal  0.159739 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  28.5 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  28.8 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46520  hypothetical protein  32.5 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374857  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  29.46 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  30 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  23.36 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  31.62 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  27.4 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  27.78 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  28.81 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  26.77 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 526 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  30.87 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  29.37 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  26.8 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  25.13 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  30.38 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0951  hypothetical protein  28.16 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1631  hypothetical protein  27.23 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.305969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3610  fatty acid hydroxylase  31.11 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  29.29 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  28.39 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  25.55 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  25.54 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  28.03 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  23.6 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  23.6 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  25.55 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2901  fatty acid hydroxylase  26.47 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800123  normal  0.025383 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  24.03 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  30.67 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  26.76 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  27.1 
 
 		 431 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  27.17 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  26.52 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1294  fatty acid hydroxylase  27.74 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.443981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  28.29 
 
 		 431 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6122  fatty acid hydroxylase  25.53 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  26.43 
 
 		 626 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  26.44 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  30.56 
 
 		 264 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  26.44 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  26.14 
 
 		 597 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  26.44 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  24.78 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  32.28 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  26.09 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11844  membrane-bound C-5 sterol desaturase erg3 (sterol-c5-desaturase)  26.25 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3502  fatty acid hydroxylase  31.3 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0956724 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  24.48 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3695  fatty acid hydroxylase  26.85 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00011612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  28.26 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  26.53 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  25.87 
 
 		 597 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3177  fatty acid hydroxylase  31.3 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  25.68 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3822  hypothetical protein  30.06 
 
 		 284 aa  57  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  27.59 
 
 		 431 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0321  fatty acid hydroxylase  29.41 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4845  fatty acid hydroxylase  30.43 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  26.4 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  28.57 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  27.03 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5467  hypothetical protein  26.71 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189673  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3145  hypothetical protein  27.74 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.168968  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  26.46 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  24.38 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  28.57 
 
 		 273 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  28.02 
 
 		 292 aa  55.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  26.32 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  25.58 
 
 		 426 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  31.01 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>