216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3134 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3134  sterol desaturase-like  100 
 
 
252 aa  509  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.278147 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3135  sterol desaturase-like  50.99 
 
 
250 aa  271  5.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  32.35 
 
 
431 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  31.62 
 
 
431 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  30.41 
 
 
430 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  30.88 
 
 
431 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3610  fatty acid hydroxylase  31.09 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  27.14 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3177  fatty acid hydroxylase  31.63 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3502  fatty acid hydroxylase  31.09 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0956724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  35.8 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5467  hypothetical protein  30.82 
 
 
411 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189673  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  30.88 
 
 
431 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4274  hypothetical protein  31.28 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  34.21 
 
 
380 aa  76.3  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  30.06 
 
 
626 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0371  putative transmembrane fatty acid synthesis protein  35.21 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  29.03 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  29.25 
 
 
597 aa  72.4  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  29.52 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3171  sterol desaturase-related protein  34.21 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.0471796 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  28.57 
 
 
597 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  30.32 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0321  fatty acid hydroxylase  30.28 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  29.73 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  30.2 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  34.36 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  28.11 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  31.61 
 
 
297 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  28.03 
 
 
281 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  28.73 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  30.08 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  29.19 
 
 
339 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  27.5 
 
 
304 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  27 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  27.5 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  28.66 
 
 
413 aa  65.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  26.73 
 
 
376 aa  65.9  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  27.44 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  27.5 
 
 
304 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  30.69 
 
 
401 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  27.5 
 
 
304 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  30.69 
 
 
401 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1074  fatty acid hydroxylase  33.56 
 
 
399 aa  65.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  28.03 
 
 
321 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3418  sterol desaturase-related protein  34.64 
 
 
306 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0225552  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  26.88 
 
 
304 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  30.15 
 
 
386 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  26.88 
 
 
304 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06935  hypothetical protein  24.63 
 
 
316 aa  63.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  27.54 
 
 
319 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  26.45 
 
 
320 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3822  hypothetical protein  30 
 
 
284 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0469  sterol desaturase-related protein  28.29 
 
 
343 aa  63.2  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.93302 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  32.89 
 
 
386 aa  63.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  30.61 
 
 
407 aa  63.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 
408 aa  62.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  27.33 
 
 
305 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  30.06 
 
 
328 aa  62.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  27.33 
 
 
305 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  27.33 
 
 
305 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46520  hypothetical protein  33.33 
 
 
282 aa  62.8  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374857  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11844  membrane-bound C-5 sterol desaturase erg3 (sterol-c5-desaturase)  26.94 
 
 
314 aa  62  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6122  fatty acid hydroxylase  30.34 
 
 
290 aa  62  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  31.29 
 
 
374 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  27.33 
 
 
303 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3145  hypothetical protein  29.45 
 
 
297 aa  61.6  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.168968  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  31.21 
 
 
295 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  24.15 
 
 
284 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1096  fatty acid hydroxylase  29.69 
 
 
310 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.354603  normal  0.159739 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  29.19 
 
 
304 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  29.79 
 
 
400 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  30.41 
 
 
426 aa  60.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  26.32 
 
 
374 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  24.12 
 
 
291 aa  60.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1130  fatty acid hydroxylase  25.88 
 
 
301 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  29.41 
 
 
287 aa  60.1  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3780  fatty acid hydroxylase  28.9 
 
 
310 aa  60.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0951  hypothetical protein  28.92 
 
 
244 aa  60.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1221  hypothetical protein  31.65 
 
 
275 aa  60.1  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31242  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  29.08 
 
 
400 aa  59.7  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  29.27 
 
 
276 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3860  hypothetical protein  27.78 
 
 
314 aa  60.1  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  27.68 
 
 
407 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  28.37 
 
 
218 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  28.37 
 
 
218 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  27.52 
 
 
402 aa  59.3  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  26.32 
 
 
274 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  25.82 
 
 
278 aa  58.9  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  28.98 
 
 
374 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2332  hypothetical protein  28.22 
 
 
304 aa  58.9  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  28.98 
 
 
373 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  26.2 
 
 
376 aa  58.9  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  28.98 
 
 
373 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  30.38 
 
 
374 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  28.67 
 
 
270 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  32.48 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  25.93 
 
 
305 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  28.93 
 
 
322 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  28.98 
 
 
301 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>