42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0467 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0467  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  261  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0454844 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  71.43 
 
 
320 aa  168  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  69.64 
 
 
305 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  69.64 
 
 
305 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  69.64 
 
 
305 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  69.64 
 
 
303 aa  167  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  69.64 
 
 
304 aa  166  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  70.54 
 
 
304 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  68.75 
 
 
304 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  67.86 
 
 
304 aa  163  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  68.75 
 
 
304 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  68.75 
 
 
304 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  68.75 
 
 
304 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  73.21 
 
 
321 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0601  hypothetical protein  69.14 
 
 
82 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2435  hypothetical protein  69.14 
 
 
82 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  45.95 
 
 
322 aa  84.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  42.2 
 
 
287 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  42.2 
 
 
287 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1130  fatty acid hydroxylase  43.75 
 
 
301 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  41.28 
 
 
287 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  42.73 
 
 
288 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1221  fatty acid hydroxylase  44.64 
 
 
301 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.387146  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  41.82 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  41.82 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  41.82 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  41.82 
 
 
287 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  41.28 
 
 
287 aa  72  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  40.37 
 
 
292 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  42.42 
 
 
314 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  40 
 
 
304 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  38.53 
 
 
315 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  40 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  37.61 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  36.7 
 
 
285 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  33.64 
 
 
274 aa  64.3  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  33.33 
 
 
270 aa  56.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  33.33 
 
 
339 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46520  hypothetical protein  34.94 
 
 
282 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374857  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3822  hypothetical protein  37.33 
 
 
284 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  76 
 
 
218 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  76 
 
 
218 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>