147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_50481 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_50481  predicted protein  100 
 
 		 471 aa  976    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.830079  normal  0.176883 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05164  30S ribosomal subunit S4, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06980)  40.76 
 
 		 457 aa  137  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00412047  normal  0.822552 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04730  nam9 protein, mitochondrial precursor, putative  27.84 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.478185  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5277  30S ribosomal protein S4  27.27 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.9692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1270  30S ribosomal protein S4  27.81 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450634  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2107  30S ribosomal protein S4  28.78 
 
 		 206 aa  56.6  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1740  30S ribosomal protein S4  25.97 
 
 		 205 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0954  30S ribosomal protein S4  27.46 
 
 		 206 aa  55.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1927  30S ribosomal protein S4  31.58 
 
 		 205 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2156  30S ribosomal protein S4  29.58 
 
 		 205 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1947  30S ribosomal protein S4  28.77 
 
 		 205 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.515321  normal  0.962011 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1016  30S ribosomal protein S4  28.78 
 
 		 205 aa  54.7  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0662506  normal  0.784633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5204  30S ribosomal protein S4  25.97 
 
 		 205 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.228879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4737  30S ribosomal protein S4  25.97 
 
 		 205 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2948  30S ribosomal protein S4  31.13 
 
 		 206 aa  54.3  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0134327 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  40.98 
 
 		 200 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2283  30S ribosomal protein S4  29.82 
 
 		 206 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0958  30S ribosomal protein S4  29.82 
 
 		 206 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0208239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1316  30S ribosomal protein S4  30.7 
 
 		 205 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4303  30S ribosomal protein S4  24.14 
 
 		 206 aa  52.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1514  30S ribosomal protein S4  33.94 
 
 		 205 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2214  30S ribosomal protein S4  29.82 
 
 		 206 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5891  RNA-binding S4 domain protein  33.01 
 
 		 146 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2011  30S ribosomal protein S4  30.97 
 
 		 208 aa  50.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0658293  normal  0.432018 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0823  30S ribosomal protein S4  26.57 
 
 		 205 aa  50.4  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0830  30S ribosomal protein S4  26.57 
 
 		 205 aa  50.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0359  30S ribosomal protein S4  25.48 
 
 		 205 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1777  30S ribosomal protein S4  33.72 
 
 		 205 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1644  30S ribosomal protein S4  42.62 
 
 		 205 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01440  SSU ribosomal protein S4P  36.47 
 
 		 197 aa  48.9  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.69794 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1619  30S ribosomal protein S4P  29.09 
 
 		 183 aa  48.9  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5388  30S ribosomal protein S4  40.98 
 
 		 205 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2396  30S ribosomal protein S4  25.87 
 
 		 205 aa  49.3  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4095  30S ribosomal protein S4  28.44 
 
 		 205 aa  49.3  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  34.07 
 
 		 206 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2249  30S ribosomal protein S4  25.32 
 
 		 205 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0123403  normal  0.0465366 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0176  ribosomal protein S4  29.73 
 
 		 200 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18917  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0623  30S ribosomal protein S4  26.79 
 
 		 208 aa  48.9  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115824  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1765  30S ribosomal protein S4  39.34 
 
 		 205 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  47.92 
 
 		 206 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3514  30S ribosomal protein S4  28.06 
 
 		 205 aa  48.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.512589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0292  30S ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 207 aa  48.5  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188387  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0369  ribosomal protein S4  28.32 
 
 		 208 aa  48.1  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1817  30S ribosomal protein S4P  37.5 
 
 		 175 aa  48.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1100  30S ribosomal protein S4P  39.06 
 
 		 177 aa  47.8  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2668  30S ribosomal protein S4  35 
 
 		 197 aa  47.4  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.544911  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2354  30S ribosomal protein S4  35 
 
 		 197 aa  47.8  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  41.51 
 
 		 208 aa  47.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  33.73 
 
 		 208 aa  47.4  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  38.6 
 
 		 201 aa  47.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1603  30S ribosomal protein S4  34.88 
 
 		 205 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.176255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12750  30S ribosomal protein S4  38.46 
 
 		 208 aa  47  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.104394  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  31.37 
 
 		 208 aa  47  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2583  30S ribosomal protein S4  25 
 
 		 206 aa  47  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal  0.610834 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3699  30S ribosomal protein S4  32.56 
 
 		 205 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.658744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1103  30S ribosomal protein S4P  38 
 
 		 181 aa  47  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.798829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1815  ribosomal protein S4  32.05 
 
 		 208 aa  47  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0105  30S ribosomal protein S4  27.36 
 
 		 205 aa  47  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  24.66 
 
 		 205 aa  47  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1156  ribosomal protein S4  45.28 
 
 		 208 aa  46.2  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000923588  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1354  30S ribosomal protein S4  38.18 
 
 		 208 aa  46.2  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3472  30S ribosomal protein S4  41.51 
 
 		 207 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3670  ribosomal protein S4  38.6 
 
 		 201 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1134  ribosomal protein S4  34.94 
 
 		 197 aa  46.6  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00609491  normal  0.0863667 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0826  30S ribosomal protein S4  25.4 
 
 		 205 aa  46.2  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0783117  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1111  30S ribosomal protein S4  32.94 
 
 		 209 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000499385  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1830  30S ribosomal protein S4  35.16 
 
 		 206 aa  46.6  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00631907  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  38.18 
 
 		 206 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0361  30S ribosomal protein S4  35.16 
 
 		 206 aa  46.6  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000770574  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1256  30S ribosomal protein S4  26.42 
 
 		 205 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  0.108405 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2814  30S ribosomal protein S4  38.18 
 
 		 207 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0136866  normal  0.264944 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2348  30S ribosomal protein S4  31.88 
 
 		 206 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1013  30S ribosomal protein S4  34.21 
 
 		 203 aa  45.8  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0175272  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1117  30S ribosomal protein S4  28.57 
 
 		 208 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0339  30S ribosomal protein S4  39.29 
 
 		 207 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.411098  normal  0.0560525 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  43.4 
 
 		 201 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1686  ribosomal protein S4  36.36 
 
 		 208 aa  45.8  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.367201  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0292  30S ribosomal protein S4  41.51 
 
 		 213 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2281  30S ribosomal protein S4  36.54 
 
 		 208 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0544941  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  32.97 
 
 		 203 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  41.82 
 
 		 209 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  41.82 
 
 		 208 aa  45.8  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2018  30S ribosomal protein S4  36.54 
 
 		 208 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0664  30S ribosomal protein S4  27.19 
 
 		 204 aa  45.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359087  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  36.21 
 
 		 206 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1216  30S ribosomal protein S4  40.35 
 
 		 208 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0261994 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.62 
 
 		 211 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0237  30S ribosomal protein S4  33.72 
 
 		 208 aa  45.1  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0862147  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2734  30S ribosomal protein S4  39.62 
 
 		 207 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  26.79 
 
 		 203 aa  44.7  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0373  30S ribosomal protein S4  39.62 
 
 		 207 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.762852  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  41.51 
 
 		 208 aa  45.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4252  ribosomal protein S4  30.39 
 
 		 206 aa  45.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000019621  unclonable  0.00000000000276102 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1548  ribosomal protein S4  33.33 
 
 		 197 aa  45.1  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0352  30S ribosomal protein S4  39.62 
 
 		 207 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0301  30S ribosomal protein S4  39.62 
 
 		 207 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152221  normal  0.0772792 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3619  30S ribosomal protein S4  39.29 
 
 		 207 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00390122  hitchhiker  0.00000000725029 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19720  SSU ribosomal protein S4P  31.13 
 
 		 198 aa  45.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000575799  normal  0.771365 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0273  30S ribosomal protein S4P  36 
 
 		 178 aa  44.7  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  25.89 
 
 		 201 aa  44.7  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>