208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB04730 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB04730  nam9 protein, mitochondrial precursor, putative  100 
 
 		 317 aa  660    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.478185  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05164  30S ribosomal subunit S4, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06980)  36.22 
 
 		 457 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00412047  normal  0.822552 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50481  predicted protein  27.84 
 
 		 471 aa  86.7  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.830079  normal  0.176883 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4818  30S ribosomal protein S4  36.49 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0954  30S ribosomal protein S4  28.4 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0359  30S ribosomal protein S4  26.9 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4095  30S ribosomal protein S4  26.74 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0105  30S ribosomal protein S4  25.86 
 
 		 205 aa  58.9  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5277  30S ribosomal protein S4  24.57 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.9692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6298  RNA-binding S4 domain-containing protein  28.57 
 
 		 201 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2249  30S ribosomal protein S4  27.33 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0123403  normal  0.0465366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4369  30S ribosomal protein S4  34.25 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4934  30S ribosomal protein S4  34.88 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  37.5 
 
 		 200 aa  57  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0176  ribosomal protein S4  34.25 
 
 		 200 aa  57  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18917  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2011  30S ribosomal protein S4  34.15 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0658293  normal  0.432018 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2948  30S ribosomal protein S4  27.22 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0134327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4737  30S ribosomal protein S4  24.57 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  29.08 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5204  30S ribosomal protein S4  24.57 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.228879 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2214  30S ribosomal protein S4  30.39 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5388  30S ribosomal protein S4  27.2 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1686  ribosomal protein S4  29.73 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.367201  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2107  30S ribosomal protein S4  28.57 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2283  30S ribosomal protein S4  29.41 
 
 		 206 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1815  ribosomal protein S4  31.82 
 
 		 208 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0958  30S ribosomal protein S4  29.41 
 
 		 206 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0208239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0874  30S ribosomal protein S4  37.14 
 
 		 205 aa  55.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.0803992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1018  30S ribosomal protein S4  37.14 
 
 		 205 aa  55.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000010559  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1016  30S ribosomal protein S4  27.03 
 
 		 205 aa  55.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0662506  normal  0.784633 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01440  SSU ribosomal protein S4P  33.33 
 
 		 197 aa  54.7  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.69794 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0623  30S ribosomal protein S4  29.63 
 
 		 208 aa  53.9  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115824  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0732  ribosomal protein S4  33.75 
 
 		 202 aa  53.9  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.50126  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2261  ribosomal protein S4  43.33 
 
 		 201 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352752  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  36.76 
 
 		 206 aa  53.1  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17660  SSU ribosomal protein S4P  30.23 
 
 		 205 aa  53.1  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.029171  normal  0.0852313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1740  30S ribosomal protein S4  26.18 
 
 		 205 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0369  ribosomal protein S4  27.78 
 
 		 208 aa  53.1  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1354  30S ribosomal protein S4  30 
 
 		 208 aa  53.1  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  37.88 
 
 		 203 aa  52.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf682  ribosomal protein S4  33.73 
 
 		 200 aa  52.8  0.000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000995603  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16370  30S ribosomal protein S4  28.33 
 
 		 208 aa  52.4  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0418  30S ribosomal protein S4  36.76 
 
 		 206 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1548  ribosomal protein S4  30.58 
 
 		 197 aa  52.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0786  30S ribosomal protein S4  25.44 
 
 		 203 aa  52.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171275  normal  0.376942 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1270  30S ribosomal protein S4  28.4 
 
 		 205 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450634  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0664  30S ribosomal protein S4  25.28 
 
 		 204 aa  52  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359087  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0394  30S ribosomal protein S4  36.76 
 
 		 206 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1013  30S ribosomal protein S4  24 
 
 		 203 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0175272  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1316  30S ribosomal protein S4  23.44 
 
 		 205 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1777  30S ribosomal protein S4  33.87 
 
 		 205 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  37.88 
 
 		 203 aa  50.8  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  28.7 
 
 		 208 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2245  30S ribosomal protein S4  24.26 
 
 		 203 aa  50.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.892305  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  35.48 
 
 		 208 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0292  30S ribosomal protein S4  30.23 
 
 		 207 aa  50.8  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188387  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1111  30S ribosomal protein S4  42.86 
 
 		 209 aa  50.8  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000499385  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  34.25 
 
 		 204 aa  50.4  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0237  30S ribosomal protein S4  28.97 
 
 		 208 aa  50.4  0.00004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0862147  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  32.53 
 
 		 209 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  37.35 
 
 		 200 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4303  30S ribosomal protein S4  31.88 
 
 		 206 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  37.88 
 
 		 203 aa  50.1  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1644  30S ribosomal protein S4  35.48 
 
 		 205 aa  50.1  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0826  30S ribosomal protein S4  22.07 
 
 		 205 aa  50.1  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0783117  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0980  30S ribosomal protein S4  38.36 
 
 		 209 aa  50.1  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.40186  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1514  30S ribosomal protein S4  24.78 
 
 		 205 aa  50.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1765  30S ribosomal protein S4  33.87 
 
 		 205 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  35.29 
 
 		 208 aa  49.7  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3152  ribosomal protein S4  26.53 
 
 		 203 aa  49.7  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  37.88 
 
 		 203 aa  49.7  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2305  ribosomal protein S4  32.58 
 
 		 209 aa  49.7  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00950883  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  36.36 
 
 		 203 aa  49.3  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19720  SSU ribosomal protein S4P  36.36 
 
 		 198 aa  49.3  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000575799  normal  0.771365 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04081  30S ribosomal protein S4  35.29 
 
 		 202 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  36.76 
 
 		 201 aa  49.3  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2583  30S ribosomal protein S4  30.38 
 
 		 206 aa  49.3  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal  0.610834 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2044  30S ribosomal protein S4  33.06 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0881453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0727  30S ribosomal protein S4  28.7 
 
 		 209 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1590  30S ribosomal protein S4  36.76 
 
 		 202 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1487  30S ribosomal protein S4  39.71 
 
 		 202 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1920  30S ribosomal protein S4  33.06 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3699  30S ribosomal protein S4  32.26 
 
 		 205 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.658744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1603  30S ribosomal protein S4  33.87 
 
 		 205 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.176255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  33.33 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0482  SSU ribosomal protein S4P  34.85 
 
 		 206 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1256  30S ribosomal protein S4  23.84 
 
 		 205 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  0.108405 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1959  30S ribosomal protein S4  33.06 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2396  30S ribosomal protein S4  25.27 
 
 		 205 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1103  30S ribosomal protein S4P  31.33 
 
 		 181 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.798829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0787  30S ribosomal protein S4  38.24 
 
 		 202 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3514  30S ribosomal protein S4  25.44 
 
 		 205 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.512589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  34.85 
 
 		 203 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  35.29 
 
 		 208 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2156  30S ribosomal protein S4  24.35 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1134  ribosomal protein S4  40.3 
 
 		 197 aa  48.1  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00609491  normal  0.0863667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3403  30S ribosomal protein S4  33.33 
 
 		 204 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.29529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1641  ribosomal protein S4  35.21 
 
 		 201 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1140  30S ribosomal protein S4  23.08 
 
 		 204 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.768431  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  32.05 
 
 		 206 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>