More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_05164 on replicon BN001305
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001305  ANIA_05164  30S ribosomal subunit S4, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06980)  100 
 
 		 457 aa  941    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00412047  normal  0.822552 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50481  predicted protein  30.72 
 
 		 471 aa  196  7e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.830079  normal  0.176883 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04730  nam9 protein, mitochondrial precursor, putative  32.5 
 
 		 317 aa  102  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.478185  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  45.45 
 
 		 205 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0292  30S ribosomal protein S4  53.85 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188387  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  52.94 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  45.83 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  55.77 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0359  30S ribosomal protein S4  40.28 
 
 		 205 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2249  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0123403  normal  0.0465366 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  56.86 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0176  ribosomal protein S4  53.85 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18917  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01440  SSU ribosomal protein S4P  48.28 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.69794 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  55.77 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5388  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  56.25 
 
 		 203 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2214  30S ribosomal protein S4  44.62 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0418  30S ribosomal protein S4  49.09 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  48.28 
 
 		 206 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0105  30S ribosomal protein S4  42.03 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  49.12 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1270  30S ribosomal protein S4  44.62 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450634  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4095  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1111  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 209 aa  58.9  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000499385  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1367  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000845169  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1777  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0394  30S ribosomal protein S4  49.09 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  49.02 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2283  30S ribosomal protein S4  44.62 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1319  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360982  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  49.18 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0954  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0958  30S ribosomal protein S4  44.62 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0208239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2668  30S ribosomal protein S4  58.33 
 
 		 197 aa  58.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.544911  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2354  30S ribosomal protein S4  58.33 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  53.85 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19720  SSU ribosomal protein S4P  47.27 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000575799  normal  0.771365 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2107  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2583  30S ribosomal protein S4  40 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal  0.610834 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  42.42 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_443  ribosomal protein S4  50 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000105703  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2302  30S ribosomal protein S4  42.03 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5046  30S ribosomal protein S4  42.65 
 
 		 207 aa  57  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1216  30S ribosomal protein S4  47.37 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0261994 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  52.08 
 
 		 203 aa  57  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  49.02 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0237  30S ribosomal protein S4  45.45 
 
 		 208 aa  57  0.0000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0862147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  57  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1619  30S ribosomal protein S4P  40.62 
 
 		 183 aa  57  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1100  30S ribosomal protein S4P  52.27 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4934  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0685  30S ribosomal protein S4  43.06 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl586  30S ribosomal protein S4  42.25 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000352215  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4218  30S ribosomal protein S4  42.65 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  38.03 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1156  ribosomal protein S4  42.5 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000923588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  50 
 
 		 208 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.08 
 
 		 211 aa  56.2  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0273  30S ribosomal protein S4P  39.39 
 
 		 178 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1740  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 205 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3699  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 205 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.658744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  47.27 
 
 		 200 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1603  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 205 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.176255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2948  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 206 aa  56.2  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0134327 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 204 aa  56.6  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  45.45 
 
 		 209 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1353  30S ribosomal protein S4P  48.89 
 
 		 178 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.49235  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 205 aa  56.6  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0625  30S ribosomal protein S4  42.03 
 
 		 207 aa  56.6  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0501  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 207 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000100385  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0104  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166577 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  38.67 
 
 		 201 aa  55.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5277  30S ribosomal protein S4  36.11 
 
 		 205 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.9692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1013  30S ribosomal protein S4  47.27 
 
 		 203 aa  55.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0175272  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1316  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 205 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5204  30S ribosomal protein S4  36.11 
 
 		 205 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.228879 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  47.06 
 
 		 203 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2232  30S ribosomal protein S4  44.12 
 
 		 208 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0017217  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2044  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 208 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0881453  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1920  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 208 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4737  30S ribosomal protein S4  36.11 
 
 		 205 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0500  30S ribosomal protein S4  41.18 
 
 		 207 aa  55.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1644  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 205 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4939  ribosomal protein S4  42.65 
 
 		 211 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00864494  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1548  ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 197 aa  55.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 208 aa  55.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0478  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 197 aa  55.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000852694  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2305  ribosomal protein S4  41.43 
 
 		 209 aa  55.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00950883  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  41.43 
 
 		 262 aa  55.5  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  45.45 
 
 		 208 aa  55.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1959  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 208 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0340  ribosomal protein S4  43.64 
 
 		 195 aa  55.1  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0429  30S ribosomal protein S4  38.24 
 
 		 209 aa  54.7  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.857828  normal  0.0845292 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0980  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 209 aa  55.1  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.40186  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1016  30S ribosomal protein S4  40 
 
 		 205 aa  55.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0662506  normal  0.784633 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  43.33 
 
 		 203 aa  54.7  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0732  RNA-binding S4 domain-containing protein  40 
 
 		 208 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130119  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0565  30S ribosomal protein S4P  46.67 
 
 		 178 aa  54.7  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 209 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>